Protein–RNA interactions for Protein: Q12016

VPS68, Vacuolar protein sorting-associated protein 68, yeastyeast

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS68Q12016 YJR079WYJR079W 330 nt1.43□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 FYV7YLR068W 456 nt1.43□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 MRPL44YMR225C 297 nt1.43□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 COX7YMR256C 183 nt1.43□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 YNL122CYNL122C 348 nt1.43□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 YPL068CYPL068C 882 nt1.43□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 YDL068WYDL068W 330 nt1.42□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 MTC7YEL033W 420 nt1.42□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 IRC19YLL033W 693 nt1.42□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 YLR202CYLR202C 327 nt1.42□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 PBI2YNL015W 228 nt1.42□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt1.42□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 GAL7YBR018C 1101 nt1.42□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 RPB5YBR154C 648 nt1.42□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 VPS8YAL002W 3825 nt1.42□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 LRE1YCL051W 1752 nt1.42□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.41□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 YLR422WYLR422W 5799 nt1.41□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 YPR097WYPR097W 3222 nt1.41□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 PET309YLR067C 2898 nt1.41□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 LSO2YGR169C-A 279 nt1.41□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 RPL16AYIL133C 600 nt1.41□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 NCE101YJL205C 162 nt1.41□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 YMR324CYMR324C 243 nt1.41□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 RTC6YPL183W-A 282 nt1.41□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 IPT1YDR072C 1584 nt1.41□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 AGC1YPR021C 2709 nt1.41□□□□□ -2.18
VPS68Q12016 NAN1YPL126W 2691 nt1.4□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 TRL1YJL087C 2484 nt1.4□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 RPF1YHR088W 888 nt1.4□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.4□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 SYM1YLR251W 594 nt1.4□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 GRX8YLR364W 330 nt1.4□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YLR456WYLR456W 615 nt1.4□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 CTK3YML112W 891 nt1.4□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 SEN15YMR059W 387 nt1.4□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 PET123YOR158W 957 nt1.4□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 SPC29YPL124W 762 nt1.4□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 UTP21YLR409C 2820 nt1.39□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 PPN1YDR452W 2025 nt1.39□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt1.39□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt1.39□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YGR045CYGR045C 363 nt1.39□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 SMD1YGR074W 441 nt1.39□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 VOA1YGR106C 798 nt1.39□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt1.39□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YOR333CYOR333C 417 nt1.39□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 LAA1YJL207C 6045 nt1.39□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 SPE1YKL184W 1401 nt1.39□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YBP1YBR216C 2025 nt1.39□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 PMD1YER132C 5262 nt1.38□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 VPS52YDR484W 1926 nt1.38□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 MUD2YKL074C 1584 nt1.38□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 CDC60YPL160W 3273 nt1.38□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 HOP2YGL033W 657 nt1.38□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.38□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.38□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 ROX1YPR065W 1107 nt1.38□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 KAR3YPR141C 2190 nt1.38□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 IST2YBR086C 2841 nt1.38□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 MSS11YMR164C 2277 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 RNH70YGR276C 1662 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 snR79snR79 84 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YER084W-AYER084W-A 513 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 COX13YGL191W 390 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 RPI1YIL119C 1224 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YLR269CYLR269C 351 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 ATP19YOL077W-A 207 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 SSK2YNR031C 4740 nt1.36□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YDL041WYDL041W 354 nt1.36□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 MXR1YER042W 555 nt1.36□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 BIG1YHR101C 1008 nt1.36□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 TOM22YNL131W 459 nt1.36□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 SNC2YOR327C 348 nt1.36□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 EGD1YPL037C 474 nt1.36□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 SLM6YBR266C 453 nt1.36□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 RTT101YJL047C 2529 nt1.36□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 RUD3YOR216C 1455 nt1.36□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.36□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 MNE1YOR350C 1992 nt1.36□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YDR341CYDR341C 1824 nt1.36□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YGR130CYGR130C 2451 nt1.35□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 SHE9YDR393W 1371 nt1.35□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 CRM1YGR218W 3255 nt1.35□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YHR130CYHR130C 336 nt1.35□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 MSL1YIR009W 336 nt1.35□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 AIM29YKR074W 468 nt1.35□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 SEC22YLR268W 645 nt1.35□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YML084WYML084W 309 nt1.35□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 TSC3YBR058C-A 243 nt1.35□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 snR41snR41 95 nt1.35□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 PIP2YOR363C 2991 nt1.35□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 CDC53YDL132W 2448 nt1.34□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YGL069CYGL069C 465 nt1.34□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.34□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YML108WYML108W 318 nt1.34□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YOR248WYOR248W 303 nt1.34□□□□□ -2.19
VPS68Q12016 YPR039WYPR039W 336 nt1.34□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 49.5 ms