Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 YPL197CYPL197C 414 nt1.96□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YBR285WYBR285W 435 nt1.96□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 MSL5YLR116W 1431 nt1.96□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 ARP7YPR034W 1434 nt1.96□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 PEP1YBL017C 4740 nt1.96□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 RAV1YJR033C 4074 nt1.96□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 GIP3YPL137C 3831 nt1.96□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YGL165CYGL165C 579 nt1.95□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.95□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 RPC10YHR143W-A 213 nt1.95□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt1.95□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YJR023CYJR023C 402 nt1.95□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YAR047CYAR047C 321 nt1.95□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YJL016WYJL016W 1686 nt1.95□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 FAB1YFR019W 6837 nt1.94□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YGR025WYGR025W 303 nt1.94□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 LAG1YHL003C 1236 nt1.94□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 SHE2YKL130C 741 nt1.94□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 IRC19YLL033W 693 nt1.94□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.94□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YBR012CYBR012C 420 nt1.94□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 VMA9YCL005W-A 222 nt1.94□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 MDM32YOR147W 1869 nt1.94□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 BUD2YKL092C 3315 nt1.94□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 LEU3YLR451W 2661 nt1.94□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 SPP41YDR464W 4308 nt1.93□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 FMP16YDR070C 282 nt1.93□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt1.93□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 TIM8YJR135W-A 264 nt1.93□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 RAM2YKL019W 951 nt1.93□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 PEX17YNL214W 600 nt1.93□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YOR392WYOR392W 444 nt1.93□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 NAN1YPL126W 2691 nt1.93□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 RRP6YOR001W 2202 nt1.93□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YJR098CYJR098C 1971 nt1.92□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YAP6YDR259C 1152 nt1.92□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 HYR1YIR037W 492 nt1.92□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 SEC22YLR268W 645 nt1.92□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YLR434CYLR434C 384 nt1.92□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YLR458WYLR458W 381 nt1.92□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.92□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YOR053WYOR053W 342 nt1.92□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 snR13snR13 124 nt1.92□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 TSC3YBR058C-A 243 nt1.92□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 UBP11YKR098C 2154 nt1.92□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 PTC5YOR090C 1719 nt1.91□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YJL181WYJL181W 1836 nt1.91□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 CDC53YDL132W 2448 nt1.91□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 NDD1YOR372C 1665 nt1.91□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YGL024WYGL024W 336 nt1.91□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YIL058WYIL058W 285 nt1.91□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 MSL1YIR009W 336 nt1.91□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt1.91□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 EGD1YPL037C 474 nt1.91□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 SET2YJL168C 2202 nt1.91□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 NUP120YKL057C 3114 nt1.91□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 REV1YOR346W 2958 nt1.9□□□□□ -2.1
YPQ1Q12010 RUD3YOR216C 1455 nt1.9□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt1.9□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 NCE101YJL205C 162 nt1.9□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 RPL37AYLR185W 267 nt1.9□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 ZEO1YOL109W 342 nt1.9□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 ERP4YOR016C 624 nt1.9□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 YPR039WYPR039W 336 nt1.9□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 GPX2YBR244W 489 nt1.9□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 MGM1YOR211C 2646 nt1.9□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 MGA2YIR033W 3342 nt1.9□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 SEC31YDL195W 3822 nt1.89□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 SDH7YDR511W 402 nt1.89□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.89□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 YBL012CYBL012C 402 nt1.89□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 MGR1YCL044C 1254 nt1.89□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 IPT1YDR072C 1584 nt1.89□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 RTT101YJL047C 2529 nt1.88□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.88□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 RTR1YER139C 681 nt1.88□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 RPL40AYIL148W 387 nt1.88□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 YKL111CYKL111C 336 nt1.88□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 BSC3YLR465C 309 nt1.88□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 YOR029WYOR029W 336 nt1.88□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 SLM6YBR266C 453 nt1.88□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 RPS24BYIL069C 408 nt1.87□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 VPS8YAL002W 3825 nt1.87□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 SPC72YAL047C 1869 nt1.87□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 COX7YMR256C 183 nt1.87□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 ATG9YDL149W 2994 nt1.87□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 NIC96YFR002W 2520 nt1.87□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 DIS3YOL021C 3006 nt1.87□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 NUP82YJL061W 2142 nt1.87□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 MKT1YNL085W 2493 nt1.86□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 NCL1YBL024W 2055 nt1.86□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.86□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.86□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 YAR068WYAR068W 486 nt1.86□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 YNL058CYNL058C 951 nt1.86□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 MRPL50YNR022C 420 nt1.86□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 YOR105WYOR105W 327 nt1.86□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 DAS1YJL149W 1992 nt1.86□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 YJL070CYJL070C 2667 nt1.86□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 VPH1YOR270C 2523 nt1.86□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 74.6 ms