Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms