Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KPNA2P52292 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms