Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARFGEF2Q9Y6D5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGEF2Q9Y6D5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms