Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms