Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
INPP4AQ96PE3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
INPP4AQ96PE3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms