Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE4Q8N205 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE4Q8N205 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE4Q8N205 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE4Q8N205 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE4Q8N205 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE4Q8N205 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE4Q8N205 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE4Q8N205 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE4Q8N205 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE4Q8N205 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE4Q8N205 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE4Q8N205 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE4Q8N205 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE4Q8N205 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms