Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms