Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE12Q6L8Q7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE12Q6L8Q7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE12Q6L8Q7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE12Q6L8Q7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE12Q6L8Q7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE12Q6L8Q7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE12Q6L8Q7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE12Q6L8Q7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE12Q6L8Q7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE12Q6L8Q7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE12Q6L8Q7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE12Q6L8Q7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms