Protein–RNA interactions for Protein: Q03654

CEF1, Pre-mRNA-splicing factor CEF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEF1Q03654 KSP1YHR082C 3090 nt2.91□□□□□ -1.94
CEF1Q03654 LEU3YLR451W 2661 nt2.91□□□□□ -1.94
CEF1Q03654 INP53YOR109W 3324 nt2.91□□□□□ -1.94
CEF1Q03654 NHP2YDL208W 471 nt2.91□□□□□ -1.94
CEF1Q03654 TWF1YGR080W 999 nt2.91□□□□□ -1.94
CEF1Q03654 YKL118WYKL118W 312 nt2.91□□□□□ -1.94
CEF1Q03654 RPS22BYLR367W 393 nt2.91□□□□□ -1.94
CEF1Q03654 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.91□□□□□ -1.94
CEF1Q03654 ESC1YMR219W 4977 nt2.91□□□□□ -1.94
CEF1Q03654 YOR296WYOR296W 3870 nt2.91□□□□□ -1.94
CEF1Q03654 ATG13YPR185W 2217 nt2.91□□□□□ -1.94
CEF1Q03654 YEF3YLR249W 3135 nt2.9□□□□□ -1.94
CEF1Q03654 TFC4YGR047C 3078 nt2.9□□□□□ -1.94
CEF1Q03654 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.9□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 NDD1YOR372C 1665 nt2.9□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.9□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.9□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.9□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.9□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.9□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.9□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.9□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.9□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 LCL1YPL056C 306 nt2.9□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 PHO2YDL106C 1680 nt2.89□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 YLR278CYLR278C 4026 nt2.89□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 SIR3YLR442C 2937 nt2.89□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 COX7YMR256C 183 nt2.89□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 YMR320WYMR320W 306 nt2.89□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt2.89□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 CSF1YLR087C 8877 nt2.89□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 SAK1YER129W 3429 nt2.89□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 YHR078WYHR078W 1659 nt2.88□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 VPS16YPL045W 2397 nt2.88□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 SDC1YDR469W 528 nt2.88□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 URM1YIL008W 300 nt2.88□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 NCE101YJL205C 162 nt2.88□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 SGM1YJR134C 2124 nt2.88□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 YPL238CYPL238C 390 nt2.88□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 YJR003CYJR003C 1560 nt2.87□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 EDS1YBR033W 2760 nt2.87□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 DBP10YDL031W 2988 nt2.87□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 VPS64YDR200C 1815 nt2.87□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 YHL037CYHL037C 402 nt2.87□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 YKR033CYKR033C 426 nt2.87□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 PRK1YIL095W 2433 nt2.87□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 TRS130YMR218C 3309 nt2.86□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 YDL152WYDL152W 366 nt2.86□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.86□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 YIL058WYIL058W 285 nt2.86□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 HYR1YIR037W 492 nt2.86□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 SNU114YKL173W 3027 nt2.86□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 YEL043WYEL043W 2871 nt2.86□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 YSW1YBR148W 1830 nt2.85□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 YDR413CYDR413C 576 nt2.85□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 YER097WYER097W 330 nt2.85□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 MAM33YIL070C 801 nt2.85□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 PAU14YIL176C 363 nt2.85□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 PAU1YJL223C 363 nt2.85□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 YBR277CYBR277C 402 nt2.85□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 COX1Q0045 1605 nt2.85□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 RSE1YML049C 4086 nt2.85□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 YPL150WYPL150W 2706 nt2.84□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 SSY1YDR160W 2559 nt2.84□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.84□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.84□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 TIM18YOR297C 579 nt2.84□□□□□ -1.95
CEF1Q03654 NUP82YJL061W 2142 nt2.84□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 VPS52YDR484W 1926 nt2.83□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 snR70snR70 164 nt2.83□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 PNC1YGL037C 651 nt2.83□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 PAU8YAL068C 363 nt2.83□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 AIM32YML050W 936 nt2.83□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt2.83□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 PAU20YOL161C 363 nt2.83□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 YPK1YKL126W 2043 nt2.83□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 OSW7YFR039C 1533 nt2.83□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 NUP100YKL068W 2880 nt2.82□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 AXL1YPR122W 3627 nt2.82□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 YJL181WYJL181W 1836 nt2.82□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 YCR022CYCR022C 345 nt2.82□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 ROX1YPR065W 1107 nt2.82□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 FKS3YMR306W 5358 nt2.82□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 SRB8YCR081W 4284 nt2.82□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 YDL041WYDL041W 354 nt2.81□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 YRB1YDR002W 606 nt2.81□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 YDR102CYDR102C 333 nt2.81□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 YIL174WYIL174W 228 nt2.81□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 RPS22AYJL190C 393 nt2.81□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.81□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 RAM2YKL019W 951 nt2.81□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 YAR053WYAR053W 297 nt2.81□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 YLR458WYLR458W 381 nt2.81□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 GIS1YDR096W 2685 nt2.8□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 YJL016WYJL016W 1686 nt2.8□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 YDR366CYDR366C 399 nt2.8□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 AAD16YFL057C 459 nt2.8□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 YFR056CYFR056C 369 nt2.8□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 ATP3YBR039W 936 nt2.8□□□□□ -1.96
CEF1Q03654 BRO1YPL084W 2535 nt2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.5 ms