Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms