Protein–RNA interactions for Protein: P53958

BOP3, Protein BOP3, yeastyeast

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BOP3P53958 YAR029WYAR029W 225 nt2.61□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YPL238CYPL238C 390 nt2.61□□□□□ -1.99
BOP3P53958 UTP14YML093W 2700 nt2.61□□□□□ -1.99
BOP3P53958 MSB1YOR188W 3414 nt2.61□□□□□ -1.99
BOP3P53958 OST1YJL002C 1431 nt2.6□□□□□ -1.99
BOP3P53958 DNF1YER166W 4716 nt2.6□□□□□ -1.99
BOP3P53958 RPL37AYLR185W 267 nt2.6□□□□□ -1.99
BOP3P53958 FPR1YNL135C 345 nt2.6□□□□□ -1.99
BOP3P53958 ISU1YPL135W 498 nt2.6□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YNL034WYNL034W 1839 nt2.6□□□□□ -1.99
BOP3P53958 SNX41YDR425W 1878 nt2.6□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YER138CYER138C 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YER160CYER160C 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YJR027WYJR027W 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YML039WYML039W 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YML045WYML045W 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YMR050CYMR050C 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 GCV2YMR189W 3105 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 HMRA2YCR096C 360 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 snR76snR76 109 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YER189WYER189W 369 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YJL202CYJL202C 348 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 GPI14YJR013W 1212 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 TIM8YJR135W-A 264 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 RGM1YMR182C 636 nt2.59□□□□□ -1.99
BOP3P53958 TPS2YDR074W 2691 nt2.59□□□□□ -2
BOP3P53958 SPF1YEL031W 3648 nt2.58□□□□□ -2
BOP3P53958 PSK2YOL045W 3306 nt2.58□□□□□ -2
BOP3P53958 TSA2YDR453C 591 nt2.58□□□□□ -2
BOP3P53958 GCN4YEL009C 846 nt2.58□□□□□ -2
BOP3P53958 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.58□□□□□ -2
BOP3P53958 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.58□□□□□ -2
BOP3P53958 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.58□□□□□ -2
BOP3P53958 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.58□□□□□ -2
BOP3P53958 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.58□□□□□ -2
BOP3P53958 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.58□□□□□ -2
BOP3P53958 YKL111CYKL111C 336 nt2.58□□□□□ -2
BOP3P53958 RPS22BYLR367W 393 nt2.58□□□□□ -2
BOP3P53958 PRE8YML092C 753 nt2.58□□□□□ -2
BOP3P53958 KTI11YBL071W-A 249 nt2.58□□□□□ -2
BOP3P53958 OSW7YFR039C 1533 nt2.58□□□□□ -2
BOP3P53958 URM1YIL008W 300 nt2.57□□□□□ -2
BOP3P53958 PAU14YIL176C 363 nt2.57□□□□□ -2
BOP3P53958 PAU1YJL223C 363 nt2.57□□□□□ -2
BOP3P53958 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.57□□□□□ -2
BOP3P53958 MRPL33YMR286W 261 nt2.57□□□□□ -2
BOP3P53958 snR36snR36 182 nt2.57□□□□□ -2
BOP3P53958 SUL1YBR294W 2580 nt2.57□□□□□ -2
BOP3P53958 ECM5YMR176W 4236 nt2.57□□□□□ -2
BOP3P53958 BNR1YIL159W 4128 nt2.57□□□□□ -2
BOP3P53958 NDD1YOR372C 1665 nt2.57□□□□□ -2
BOP3P53958 YIL080WYIL080W 4722 nt2.56□□□□□ -2
BOP3P53958 INO80YGL150C 4470 nt2.56□□□□□ -2
BOP3P53958 HOP2YGL033W 657 nt2.56□□□□□ -2
BOP3P53958 RPL36AYMR194W 303 nt2.56□□□□□ -2
BOP3P53958 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt2.56□□□□□ -2
BOP3P53958 ATP15YPL271W 189 nt2.56□□□□□ -2
BOP3P53958 YDR239CYDR239C 2364 nt2.56□□□□□ -2
BOP3P53958 YOL098CYOL098C 3114 nt2.55□□□□□ -2
BOP3P53958 CAJ1YER048C 1176 nt2.55□□□□□ -2
BOP3P53958 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.55□□□□□ -2
BOP3P53958 MSL1YIR009W 336 nt2.55□□□□□ -2
BOP3P53958 YEF3YLR249W 3135 nt2.55□□□□□ -2
BOP3P53958 LEU3YLR451W 2661 nt2.55□□□□□ -2
BOP3P53958 RPL25YOL127W 429 nt2.55□□□□□ -2
BOP3P53958 BIL1YOR304C-A 231 nt2.55□□□□□ -2
BOP3P53958 TRM7YBR061C 933 nt2.55□□□□□ -2
BOP3P53958 SSN2YDR443C 4263 nt2.54□□□□□ -2
BOP3P53958 UBP15YMR304W 3693 nt2.54□□□□□ -2
BOP3P53958 SMC6YLR383W 3345 nt2.54□□□□□ -2
BOP3P53958 STE5YDR103W 2754 nt2.54□□□□□ -2
BOP3P53958 YFR056CYFR056C 369 nt2.54□□□□□ -2
BOP3P53958 PEX4YGR133W 552 nt2.54□□□□□ -2
BOP3P53958 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.54□□□□□ -2
BOP3P53958 SHE2YKL130C 741 nt2.54□□□□□ -2
BOP3P53958 DNA2YHR164C 4569 nt2.53□□□□□ -2
BOP3P53958 PSO2YMR137C 1986 nt2.53□□□□□ -2
BOP3P53958 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.53□□□□□ -2
BOP3P53958 MCM22YJR135C 720 nt2.53□□□□□ -2
BOP3P53958 COX7YMR256C 183 nt2.53□□□□□ -2
BOP3P53958 YMR320WYMR320W 306 nt2.53□□□□□ -2
BOP3P53958 PGA1YNL158W 597 nt2.53□□□□□ -2
BOP3P53958 YSW1YBR148W 1830 nt2.52□□□□□ -2.01
BOP3P53958 NCE101YJL205C 162 nt2.52□□□□□ -2.01
BOP3P53958 YLR031WYLR031W 561 nt2.52□□□□□ -2.01
BOP3P53958 COX1Q0045 1605 nt2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.8 ms