Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KPNA2P52292 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms