Protein–RNA interactions for Protein: P21538

REB1, DNA-binding protein REB1, yeastyeast

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
REB1P21538 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt5.59□□□□□ -1.51
REB1P21538 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt5.59□□□□□ -1.51
REB1P21538 YDR193WYDR193W 399 nt5.59□□□□□ -1.51
REB1P21538 YGR050CYGR050C 357 nt5.59□□□□□ -1.51
REB1P21538 PEP3YLR148W 2757 nt5.59□□□□□ -1.52
REB1P21538 NAM2YLR382C 2685 nt5.59□□□□□ -1.52
REB1P21538 SEC39YLR440C 2130 nt5.59□□□□□ -1.52
REB1P21538 INP2YMR163C 2118 nt5.59□□□□□ -1.52
REB1P21538 APC1YNL172W 5247 nt5.58□□□□□ -1.52
REB1P21538 FZO1YBR179C 2568 nt5.58□□□□□ -1.52
REB1P21538 YOL075CYOL075C 3885 nt5.57□□□□□ -1.52
REB1P21538 MSK1YNL073W 1731 nt5.57□□□□□ -1.52
REB1P21538 ELG1YOR144C 2376 nt5.57□□□□□ -1.52
REB1P21538 SLD3YGL113W 2007 nt5.57□□□□□ -1.52
REB1P21538 PUF4YGL014W 2667 nt5.57□□□□□ -1.52
REB1P21538 RRN6YBL014C 2685 nt5.57□□□□□ -1.52
REB1P21538 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt5.57□□□□□ -1.52
REB1P21538 RPL25YOL127W 429 nt5.57□□□□□ -1.52
REB1P21538 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.57□□□□□ -1.52
REB1P21538 GIN4YDR507C 3429 nt5.56□□□□□ -1.52
REB1P21538 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt5.56□□□□□ -1.52
REB1P21538 snR32snR32 188 nt5.56□□□□□ -1.52
REB1P21538 DOT6YER088C 2013 nt5.56□□□□□ -1.52
REB1P21538 NMA111YNL123W 2994 nt5.55□□□□□ -1.52
REB1P21538 TGL4YKR089C 2733 nt5.55□□□□□ -1.52
REB1P21538 GLT1YDL171C 6438 nt5.55□□□□□ -1.52
REB1P21538 YNL266WYNL266W 420 nt5.55□□□□□ -1.52
REB1P21538 ABP140YOR239W 1887 nt5.55□□□□□ -1.52
REB1P21538 NUP2YLR335W 2163 nt5.55□□□□□ -1.52
REB1P21538 FYV10YIL097W 1551 nt5.55□□□□□ -1.52
REB1P21538 AXL2YIL140W 2472 nt5.54□□□□□ -1.52
REB1P21538 RCO1YMR075W 2055 nt5.54□□□□□ -1.52
REB1P21538 LSO2YGR169C-A 279 nt5.54□□□□□ -1.52
REB1P21538 UBA1YKL210W 3075 nt5.54□□□□□ -1.52
REB1P21538 SPO75YLL005C 2607 nt5.54□□□□□ -1.52
REB1P21538 EFR3YMR212C 2349 nt5.53□□□□□ -1.52
REB1P21538 PHD1YKL043W 1101 nt5.52□□□□□ -1.53
REB1P21538 DNF2YDR093W 4839 nt5.51□□□□□ -1.53
REB1P21538 VID27YNL212W 2349 nt5.51□□□□□ -1.53
REB1P21538 HYP2YEL034W 474 nt5.51□□□□□ -1.53
REB1P21538 YJR085CYJR085C 318 nt5.51□□□□□ -1.53
REB1P21538 YKL050CYKL050C 2769 nt5.51□□□□□ -1.53
REB1P21538 AI2Q0055 2565 nt5.5□□□□□ -1.53
REB1P21538 YHR182WYHR182W 2358 nt5.5□□□□□ -1.53
REB1P21538 ISM1YPL040C 3009 nt5.5□□□□□ -1.53
REB1P21538 TEL1YBL088C 8364 nt5.49□□□□□ -1.53
REB1P21538 RPL31AYDL075W 342 nt5.49□□□□□ -1.53
REB1P21538 ROG1YGL144C 2058 nt5.48□□□□□ -1.53
REB1P21538 AUA1YFL010W-A 285 nt5.48□□□□□ -1.53
REB1P21538 YFL065CYFL065C 309 nt5.48□□□□□ -1.53
REB1P21538 YPR203WYPR203W 309 nt5.48□□□□□ -1.53
REB1P21538 FIG4YNL325C 2640 nt5.48□□□□□ -1.53
REB1P21538 SLY1YDR189W 2001 nt5.48□□□□□ -1.53
REB1P21538 LYS14YDR034C 2373 nt5.48□□□□□ -1.53
REB1P21538 YER039C-AYER039C-A 219 nt5.47□□□□□ -1.53
REB1P21538 SPC105YGL093W 2754 nt5.46□□□□□ -1.53
REB1P21538 RPS17BYDR447C 411 nt5.46□□□□□ -1.54
REB1P21538 MSD1YPL104W 1977 nt5.46□□□□□ -1.54
REB1P21538 NPR1YNL183C 2373 nt5.45□□□□□ -1.54
REB1P21538 SIP3YNL257C 3690 nt5.45□□□□□ -1.54
REB1P21538 snR53snR53 91 nt5.45□□□□□ -1.54
REB1P21538 UTP8YGR128C 2142 nt5.45□□□□□ -1.54
REB1P21538 NIP100YPL174C 2607 nt5.44□□□□□ -1.54
REB1P21538 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt5.44□□□□□ -1.54
REB1P21538 SMT3YDR510W 306 nt5.44□□□□□ -1.54
REB1P21538 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt5.44□□□□□ -1.54
REB1P21538 ERB1YMR049C 2424 nt5.44□□□□□ -1.54
REB1P21538 BBC1YJL020C 3474 nt5.43□□□□□ -1.54
REB1P21538 VHS3YOR054C 2025 nt5.43□□□□□ -1.54
REB1P21538 STE20YHL007C 2820 nt5.42□□□□□ -1.54
REB1P21538 DUF1YOL087C 3351 nt5.42□□□□□ -1.54
REB1P21538 TAF6YGL112C 1551 nt5.42□□□□□ -1.54
REB1P21538 PDR15YDR406W 4590 nt5.42□□□□□ -1.54
REB1P21538 IES6YEL044W 501 nt5.42□□□□□ -1.54
REB1P21538 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt5.42□□□□□ -1.54
REB1P21538 NAT1YDL040C 2565 nt5.42□□□□□ -1.54
REB1P21538 POL1YNL102W 4407 nt5.41□□□□□ -1.54
REB1P21538 COG3YER157W 2406 nt5.41□□□□□ -1.54
REB1P21538 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt5.41□□□□□ -1.54
REB1P21538 VMA9YCL005W-A 222 nt5.41□□□□□ -1.54
REB1P21538 IMH1YLR309C 2736 nt5.41□□□□□ -1.54
REB1P21538 YFR016CYFR016C 3702 nt5.4□□□□□ -1.54
REB1P21538 TAF5YBR198C 2397 nt5.4□□□□□ -1.54
REB1P21538 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt5.4□□□□□ -1.54
REB1P21538 ATG13YPR185W 2217 nt5.4□□□□□ -1.55
REB1P21538 COS111YBR203W 2775 nt5.39□□□□□ -1.55
REB1P21538 GAL4YPL248C 2646 nt5.39□□□□□ -1.55
REB1P21538 YGR269WYGR269W 327 nt5.39□□□□□ -1.55
REB1P21538 ARO80YDR421W 2853 nt5.39□□□□□ -1.55
REB1P21538 RIM15YFL033C 5313 nt5.38□□□□□ -1.55
REB1P21538 AKL1YBR059C 3327 nt5.38□□□□□ -1.55
REB1P21538 YDR089WYDR089W 2610 nt5.37□□□□□ -1.55
REB1P21538 YML116W-AYML116W-A 303 nt5.37□□□□□ -1.55
REB1P21538 RAD54YGL163C 2697 nt5.37□□□□□ -1.55
REB1P21538 BCH1YMR237W 2175 nt5.36□□□□□ -1.55
REB1P21538 COX5BYIL111W 456 nt5.36□□□□□ -1.55
REB1P21538 NUP85YJR042W 2235 nt5.36□□□□□ -1.55
REB1P21538 IOC2YLR095C 2439 nt5.36□□□□□ -1.55
REB1P21538 VPH1YOR270C 2523 nt5.36□□□□□ -1.55
REB1P21538 KAP104YBR017C 2757 nt5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8 ms