Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD21O60216 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD21O60216 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD21O60216 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD21O60216 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD21O60216 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD21O60216 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD21O60216 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD21O60216 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD21O60216 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD21O60216 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD21O60216 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD21O60216 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD21O60216 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD21O60216 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD21O60216 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD21O60216 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD21O60216 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD21O60216 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD21O60216 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD21O60216 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD21O60216 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD21O60216 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD21O60216 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD21O60216 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD21O60216 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD21O60216 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD21O60216 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD21O60216 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD21O60216 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD21O60216 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD21O60216 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD21O60216 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD21O60216 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD21O60216 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD21O60216 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD21O60216 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD21O60216 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD21O60216 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD21O60216 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD21O60216 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD21O60216 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD21O60216 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD21O60216 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD21O60216 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD21O60216 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD21O60216 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD21O60216 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD21O60216 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD21O60216 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD21O60216 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD21O60216 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD21O60216 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD21O60216 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD21O60216 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD21O60216 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD21O60216 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD21O60216 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD21O60216 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD21O60216 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD21O60216 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD21O60216 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD21O60216 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD21O60216 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD21O60216 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD21O60216 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD21O60216 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD21O60216 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD21O60216 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD21O60216 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD21O60216 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD21O60216 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD21O60216 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD21O60216 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD21O60216 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD21O60216 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD21O60216 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms