Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
BHMG1C9JSJ3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms