Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.116e-7■■■■□ 21.2
EXOSC5Q9NQT4 PLCB1-214ENST00000626161 706 ntTSL 513.58□□□□□ -0.246e-7■■■■□ 21.2
EXOSC5Q9NQT4 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.446e-7■■■■□ 21.2
EXOSC5Q9NQT4 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.326e-7■■■■□ 21.2
EXOSC5Q9NQT4 PLCB1-219ENST00000630495 759 ntTSL 56.76□□□□□ -1.336e-7■■■■□ 21.2
EXOSC5Q9NQT4 PLCB1-212ENST00000625874 3206 ntTSL 26.36□□□□□ -1.396e-7■■■■□ 21.2
EXOSC5Q9NQT4 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.786e-7■■■■□ 21.2
EXOSC5Q9NQT4 LSM3-201ENST00000306024 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.872e-7■■■■□ 21.1
EXOSC5Q9NQT4 PELP1-213ENST00000575101 442 ntTSL 314.9□□□□□ -0.024e-7■■■■□ 21.1
EXOSC5Q9NQT4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.034e-7■■■■□ 21.1
EXOSC5Q9NQT4 PELP1-214ENST00000575329 3280 ntTSL 213.68□□□□□ -0.224e-7■■■■□ 21.1
EXOSC5Q9NQT4 PELP1-204ENST00000570571 902 ntTSL 313.22□□□□□ -0.294e-7■■■■□ 21.1
EXOSC5Q9NQT4 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.364e-7■■■■□ 21.1
EXOSC5Q9NQT4 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.414e-7■■■■□ 21.1
EXOSC5Q9NQT4 PELP1-211ENST00000573523 3878 ntTSL 212.27□□□□□ -0.444e-7■■■■□ 21.1
EXOSC5Q9NQT4 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.464e-7■■■■□ 21.1
EXOSC5Q9NQT4 PELP1-203ENST00000570387 567 ntTSL 57.51□□□□□ -1.214e-7■■■■□ 21.1
EXOSC5Q9NQT4 PUM1-215ENST00000525948 1103 ntTSL 38.55□□□□□ -1.043e-7■■■■□ 21.1
EXOSC5Q9NQT4 PUM1-209ENST00000480602 906 ntTSL 56.92□□□□□ -1.33e-7■■■■□ 21.1
EXOSC5Q9NQT4 ADNP2-204ENST00000560752 880 ntTSL 521.8■■□□□ 1.083e-7■■■■□ 21.1
EXOSC5Q9NQT4 ADNP2-202ENST00000559951 823 ntTSL 316.78■□□□□ 0.283e-7■■■■□ 21.1
EXOSC5Q9NQT4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.223e-7■■■■□ 21.1
EXOSC5Q9NQT4 ADNP2-205ENST00000561195 124 ntTSL 35.78□□□□□ -1.483e-7■■■■□ 21.1
EXOSC5Q9NQT4 ADNP2-203ENST00000560561 647 ntTSL 34.62□□□□□ -1.673e-7■■■■□ 21.1
EXOSC5Q9NQT4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.365e-7■■■■□ 21
EXOSC5Q9NQT4 DYRK1A-204ENST00000398960 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.985e-7■■■■□ 21
EXOSC5Q9NQT4 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.615e-7■■■■□ 21
EXOSC5Q9NQT4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 21
EXOSC5Q9NQT4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 21
EXOSC5Q9NQT4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 21
EXOSC5Q9NQT4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 21
EXOSC5Q9NQT4 CCNY-209ENST00000493157 816 ntTSL 513.32□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 21
EXOSC5Q9NQT4 CCNY-207ENST00000490012 793 ntTSL 312.84□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 21
EXOSC5Q9NQT4 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.52e-6■■■■□ 21
EXOSC5Q9NQT4 CCNY-204ENST00000374706 3940 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 21
EXOSC5Q9NQT4 CCNY-208ENST00000492478 809 ntTSL 57.47□□□□□ -1.212e-6■■■■□ 21
EXOSC5Q9NQT4 BLCAP-213ENST00000467603 439 ntTSL 312.53□□□□□ -0.42e-8■■■■□ 21
EXOSC5Q9NQT4 MAP3K7-204ENST00000369329 4911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 20.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP3K7-205ENST00000369332 4830 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.822e-6■■■■□ 20.9
EXOSC5Q9NQT4 PSMB2-201ENST00000373237 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.832e-6■■■■□ 20.9
EXOSC5Q9NQT4 PSMB2-203ENST00000630477 1127 ntTSL 1 (best)8.96□□□□□ -0.982e-6■■■■□ 20.9
EXOSC5Q9NQT4 COA1-203ENST00000395879 2448 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.165e-7■■■■□ 20.9
EXOSC5Q9NQT4 COA1-219ENST00000490251 2135 ntTSL 27.39□□□□□ -1.235e-7■■■■□ 20.9
EXOSC5Q9NQT4 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.452e-6■■■■□ 20.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.672e-6■■■■□ 20.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.912e-6■■■■□ 20.9
EXOSC5Q9NQT4 SMAP2-201ENST00000372708 2473 ntTSL 1 (best)8.68□□□□□ -1.023e-7■■■■□ 20.9
EXOSC5Q9NQT4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.216e-7■■■■□ 20.9
EXOSC5Q9NQT4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.026e-7■■■■□ 20.9
EXOSC5Q9NQT4 ZNF644-211ENST00000498303 514 ntTSL 1 (best)11.29□□□□□ -0.66e-7■■■■□ 20.9
EXOSC5Q9NQT4 ZNF644-202ENST00000347275 2036 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.176e-7■■■■□ 20.9
EXOSC5Q9NQT4 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.526e-7■■■■□ 20.9
EXOSC5Q9NQT4 ZNF644-205ENST00000467231 851 ntTSL 32.45□□□□□ -2.026e-7■■■■□ 20.9
EXOSC5Q9NQT4 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.534e-7■■■■□ 20.9
EXOSC5Q9NQT4 DOT1L-203ENST00000452696 624 ntTSL 311.56□□□□□ -0.564e-7■■■■□ 20.9
EXOSC5Q9NQT4 PRR4-209ENST00000541456 454 ntTSL 35.27□□□□□ -1.572e-7■■■■□ 20.9
EXOSC5Q9NQT4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.141e-6■■■■□ 20.8
EXOSC5Q9NQT4 MAGI3-206ENST00000486456 897 ntTSL 515.73■□□□□ 0.111e-6■■■■□ 20.8
EXOSC5Q9NQT4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.011e-6■■■■□ 20.8
EXOSC5Q9NQT4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.121e-6■■■■□ 20.8
EXOSC5Q9NQT4 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.391e-6■■■■□ 20.8
EXOSC5Q9NQT4 TBL1XR1-227ENST00000636478 100 ntTSL 50.95□□□□□ -2.268e-7■■■■□ 20.8
EXOSC5Q9NQT4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.12e-6■■■■□ 20.8
EXOSC5Q9NQT4 GSK3B-202ENST00000316626 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.042e-6■■■■□ 20.8
EXOSC5Q9NQT4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.086e-7■■■■□ 20.8
EXOSC5Q9NQT4 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.326e-7■■■■□ 20.8
EXOSC5Q9NQT4 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.476e-7■■■■□ 20.8
EXOSC5Q9NQT4 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.536e-7■■■■□ 20.8
EXOSC5Q9NQT4 SPG11-201ENST00000261866 7774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.636e-7■■■■□ 20.8
EXOSC5Q9NQT4 SPG11-204ENST00000557866 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 26.29□□□□□ -1.46e-7■■■■□ 20.8
EXOSC5Q9NQT4 TOP1-201ENST00000361337 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.134e-6■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.073e-9■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.193e-9■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.23e-9■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.213e-6■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.33e-6■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.383e-6■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.553e-6■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.333e-6■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 NR3C1-211ENST00000504336 611 ntTSL 23.86□□□□□ -1.793e-6■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.793e-6■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.83e-6■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.943e-6■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.236e-7■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 GRB10-202ENST00000357271 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.656e-7■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 GRB10-210ENST00000407526 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.786e-7■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 GRB10-204ENST00000398812 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.056e-7■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 GRB10-203ENST00000398810 4785 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.086e-7■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 GRB10-209ENST00000406641 2700 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.126e-7■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.176e-7■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 BRD4-208ENST00000597315 892 ntTSL 521.3■■□□□ 11e-6■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.821e-6■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.41e-6■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 BRD4-205ENST00000594841 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.74□□□□□ -0.371e-6■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 BRD4-210ENST00000601941 604 ntTSL 510.66□□□□□ -0.71e-6■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.255e-7■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.635e-7■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.425e-7■■■■□ 20.7
EXOSC5Q9NQT4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.649e-8■■■■□ 20.6
EXOSC5Q9NQT4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.199e-8■■■■□ 20.6
Retrieved 100 of 8,799 protein–RNA pairs in 486.9 ms