Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms