Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms