Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCTN1Q2MV58 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTN1Q2MV58 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms