Protein–RNA interactions for Protein: Q03785

VHS1, Serine/threonine-protein kinase VHS1, yeastyeast

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1Q03785 TRM2YKR056W 1920 nt2.11□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 SPO23YBR250W 1572 nt2.11□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 YDR157WYDR157W 402 nt2.11□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 GIM4YEL003W 336 nt2.11□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 GCN4YEL009C 846 nt2.11□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 ERV1YGR029W 570 nt2.11□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 CRG1YHR209W 876 nt2.11□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.11□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 ARV1YLR242C 966 nt2.11□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.11□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 YPL261CYPL261C 309 nt2.11□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 RLI1YDR091C 1827 nt2.11□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 NOP14YDL148C 2433 nt2.11□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 SPB1YCL054W 2526 nt2.11□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 YER079WYER079W 633 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 RPS26BYER131W 360 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 YMR31YFR049W 372 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 YLR269CYLR269C 351 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 RPS22BYLR367W 393 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 YOL150CYOL150C 312 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 ISU1YPL135W 498 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 YPR012WYPR012W 255 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 ARR2YPR200C 393 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 APC2YLR127C 2562 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 SNF12YNR023W 1701 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 COG3YER157W 2406 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 KAP123YER110C 3342 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 SAP185YJL098W 3177 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 MES1YGR264C 2256 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 SIP3YNL257C 3690 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 GCV2YMR189W 3105 nt2.09□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 FUS1YCL027W 1539 nt2.09□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 FYV4YHR059W 393 nt2.09□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.09□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 YLR101CYLR101C 396 nt2.09□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 YML108WYML108W 318 nt2.09□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.09□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 ESF2YNR054C 951 nt2.09□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 RPL25YOL127W 429 nt2.09□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 CDC33YOL139C 642 nt2.09□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 PEP12YOR036W 867 nt2.09□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 FYV12YOR183W 390 nt2.09□□□□□ -2.07
VHS1Q03785 YIL080WYIL080W 4722 nt2.09□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 ALK2YBL009W 2031 nt2.08□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 ELG1YOR144C 2376 nt2.08□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 GPI8YDR331W 1236 nt2.08□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 ECL1YGR146C 636 nt2.08□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.08□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.08□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.08□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.08□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 BRE1YDL074C 2103 nt2.07□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 TIF35YDR429C 825 nt2.07□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YPS5YGL259W 498 nt2.07□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YJR079WYJR079W 330 nt2.07□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YNL046WYNL046W 519 nt2.07□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 FPR1YNL135C 345 nt2.07□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YPL039WYPL039W 951 nt2.07□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 NPR1YNL183C 2373 nt2.07□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 EDS1YBR033W 2760 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YDR269CYDR269C 324 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 GLC7YER133W 939 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YER135CYER135C 393 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 BRP1YGL007W 378 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 BIG1YHR101C 1008 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YHR138CYHR138C 345 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 TPM2YIL138C 486 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 TEN1YLR010C 483 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 RPS29AYLR388W 171 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 OST2YOR103C 393 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 PUF4YGL014W 2667 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 RLF2YPR018W 1821 nt2.05□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 RAD6YGL058W 519 nt2.05□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 EMP24YGL200C 612 nt2.05□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 NOP19YGR251W 591 nt2.05□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 NOP15YNL110C 663 nt2.05□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 COQ10YOL008W 624 nt2.05□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YOL134CYOL134C 390 nt2.05□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.05□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 SPP41YDR464W 4308 nt2.05□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YRB1YDR002W 606 nt2.04□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 SWA2YDR320C 2007 nt2.04□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 RRF1YHR038W 693 nt2.04□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.04□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 NFU1YKL040C 771 nt2.04□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YOL159CYOL159C 516 nt2.04□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 snR54snR54 86 nt2.04□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 TOR2YKL203C 7425 nt2.04□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 AMS1YGL156W 3252 nt2.03□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 GPI17YDR434W 1605 nt2.03□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.03□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 RTR2YDR066C 591 nt2.03□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt2.03□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 PEP8YJL053W 1140 nt2.03□□□□□ -2.08
VHS1Q03785 SPC1YJR010C-A 285 nt2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.3 ms