Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC24CP53992 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms