Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA2P52292 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.9 ms