Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 YGL109WYGL109W 324 nt1.67□□□□□ -2.14
DDI1P40087 SMD1YGR074W 441 nt1.67□□□□□ -2.14
DDI1P40087 ACF4YJR083C 930 nt1.67□□□□□ -2.14
DDI1P40087 CSE4YKL049C 690 nt1.67□□□□□ -2.14
DDI1P40087 TEN1YLR010C 483 nt1.67□□□□□ -2.14
DDI1P40087 YLR366WYLR366W 306 nt1.67□□□□□ -2.14
DDI1P40087 SPO22YIL073C 2928 nt1.67□□□□□ -2.14
DDI1P40087 YNL144CYNL144C 2223 nt1.67□□□□□ -2.14
DDI1P40087 NAM7YMR080C 2916 nt1.67□□□□□ -2.14
DDI1P40087 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.66□□□□□ -2.14
DDI1P40087 YDL009CYDL009C 324 nt1.66□□□□□ -2.14
DDI1P40087 BMT5YIL096C 1011 nt1.66□□□□□ -2.14
DDI1P40087 PEP8YJL053W 1140 nt1.66□□□□□ -2.14
DDI1P40087 ATP18YML081C-A 180 nt1.66□□□□□ -2.14
DDI1P40087 RBL2YOR265W 321 nt1.66□□□□□ -2.14
DDI1P40087 TAZ1YPR140W 1146 nt1.66□□□□□ -2.14
DDI1P40087 YBR287WYBR287W 1284 nt1.66□□□□□ -2.14
DDI1P40087 YJL016WYJL016W 1686 nt1.66□□□□□ -2.14
DDI1P40087 BRO1YPL084W 2535 nt1.66□□□□□ -2.14
DDI1P40087 MEC1YBR136W 7107 nt1.65□□□□□ -2.14
DDI1P40087 CRD1YDL142C 852 nt1.65□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YDL163WYDL163W 303 nt1.65□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YDR286CYDR286C 345 nt1.65□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YDR537CYDR537C 606 nt1.65□□□□□ -2.15
DDI1P40087 HRI1YLR301W 735 nt1.65□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt1.65□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt1.65□□□□□ -2.15
DDI1P40087 PET309YLR067C 2898 nt1.65□□□□□ -2.15
DDI1P40087 KIP1YBL063W 3336 nt1.65□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YDL062WYDL062W 426 nt1.64□□□□□ -2.15
DDI1P40087 DFG10YIL049W 762 nt1.64□□□□□ -2.15
DDI1P40087 RPI1YIL119C 1224 nt1.64□□□□□ -2.15
DDI1P40087 GRX8YLR364W 330 nt1.64□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YNL226WYNL226W 411 nt1.64□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YPR170CYPR170C 336 nt1.64□□□□□ -2.15
DDI1P40087 VMR1YHL035C 4779 nt1.64□□□□□ -2.15
DDI1P40087 HSH155YMR288W 2916 nt1.64□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.63□□□□□ -2.15
DDI1P40087 FAR7YFR008W 666 nt1.63□□□□□ -2.15
DDI1P40087 EMP24YGL200C 612 nt1.63□□□□□ -2.15
DDI1P40087 RPA34YJL148W 702 nt1.63□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YOR392WYOR392W 444 nt1.63□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YPL238CYPL238C 390 nt1.63□□□□□ -2.15
DDI1P40087 CRM1YGR218W 3255 nt1.63□□□□□ -2.15
DDI1P40087 TUS1YLR425W 3924 nt1.62□□□□□ -2.15
DDI1P40087 PKH3YDR466W 2697 nt1.62□□□□□ -2.15
DDI1P40087 BTT1YDR252W 450 nt1.62□□□□□ -2.15
DDI1P40087 PGD1YGL025C 1194 nt1.62□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt1.62□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YJL119CYJL119C 324 nt1.62□□□□□ -2.15
DDI1P40087 RPC25YKL144C 639 nt1.62□□□□□ -2.15
DDI1P40087 SDS22YKL193C 1017 nt1.62□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YLR031WYLR031W 561 nt1.62□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YNL150WYNL150W 408 nt1.62□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YOR105WYOR105W 327 nt1.62□□□□□ -2.15
DDI1P40087 FIG2YCR089W 4830 nt1.62□□□□□ -2.15
DDI1P40087 GRR1YJR090C 3456 nt1.61□□□□□ -2.15
DDI1P40087 LAG1YHL003C 1236 nt1.61□□□□□ -2.15
DDI1P40087 TPM2YIL138C 486 nt1.61□□□□□ -2.15
DDI1P40087 SYM1YLR251W 594 nt1.61□□□□□ -2.15
DDI1P40087 ATP15YPL271W 189 nt1.61□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YCL002CYCL002C 792 nt1.61□□□□□ -2.15
DDI1P40087 SLM1YIL105C 2061 nt1.61□□□□□ -2.15
DDI1P40087 PEX8YGR077C 1770 nt1.61□□□□□ -2.15
DDI1P40087 RKM1YPL208W 1752 nt1.61□□□□□ -2.15
DDI1P40087 STB4YMR019W 2850 nt1.6□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.6□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YOR364WYOR364W 369 nt1.6□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.6□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YCL023CYCL023C 348 nt1.6□□□□□ -2.15
DDI1P40087 SOK2YMR016C 2358 nt1.59□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YJR039WYJR039W 3366 nt1.59□□□□□ -2.15
DDI1P40087 SPE1YKL184W 1401 nt1.59□□□□□ -2.15
DDI1P40087 snR5snR5 204 nt1.59□□□□□ -2.15
DDI1P40087 MZM1YDR493W 372 nt1.59□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YER038W-AYER038W-A 381 nt1.59□□□□□ -2.15
DDI1P40087 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.59□□□□□ -2.15
DDI1P40087 ARV1YLR242C 966 nt1.59□□□□□ -2.15
DDI1P40087 GAL80YML051W 1308 nt1.59□□□□□ -2.16
DDI1P40087 RPH1YER169W 2391 nt1.58□□□□□ -2.16
DDI1P40087 APM3YBR288C 1452 nt1.58□□□□□ -2.16
DDI1P40087 snR83snR83 306 nt1.58□□□□□ -2.16
DDI1P40087 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt1.58□□□□□ -2.16
DDI1P40087 DAD4YDR320C-A 219 nt1.58□□□□□ -2.16
DDI1P40087 HSK3YKL138C-A 210 nt1.58□□□□□ -2.16
DDI1P40087 MRPL44YMR225C 297 nt1.58□□□□□ -2.16
DDI1P40087 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt1.58□□□□□ -2.16
DDI1P40087 YNL010WYNL010W 726 nt1.58□□□□□ -2.16
DDI1P40087 GRX5YPL059W 453 nt1.58□□□□□ -2.16
DDI1P40087 YBR174CYBR174C 315 nt1.58□□□□□ -2.16
DDI1P40087 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt1.58□□□□□ -2.16
DDI1P40087 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt1.58□□□□□ -2.16
DDI1P40087 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt1.58□□□□□ -2.16
DDI1P40087 YCL020WYCL020W 1317 nt1.58□□□□□ -2.16
DDI1P40087 RRI2YOL117W 1938 nt1.58□□□□□ -2.16
DDI1P40087 DPB11YJL090C 2295 nt1.57□□□□□ -2.16
DDI1P40087 ARP7YPR034W 1434 nt1.57□□□□□ -2.16
DDI1P40087 PLC1YPL268W 2610 nt1.57□□□□□ -2.16
DDI1P40087 HSL1YKL101W 4557 nt1.57□□□□□ -2.16
DDI1P40087 BET4YJL031C 984 nt1.57□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.3 ms