Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERPUD2Q9BSE4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERPUD2Q9BSE4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERPUD2Q9BSE4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HERPUD2Q9BSE4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERPUD2Q9BSE4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERPUD2Q9BSE4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERPUD2Q9BSE4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERPUD2Q9BSE4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERPUD2Q9BSE4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HERPUD2Q9BSE4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HERPUD2Q9BSE4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HERPUD2Q9BSE4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HERPUD2Q9BSE4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HERPUD2Q9BSE4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERPUD2Q9BSE4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERPUD2Q9BSE4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERPUD2Q9BSE4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERPUD2Q9BSE4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERPUD2Q9BSE4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HERPUD2Q9BSE4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERPUD2Q9BSE4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HERPUD2Q9BSE4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HERPUD2Q9BSE4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HERPUD2Q9BSE4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HERPUD2Q9BSE4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HERPUD2Q9BSE4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HERPUD2Q9BSE4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERPUD2Q9BSE4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERPUD2Q9BSE4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HERPUD2Q9BSE4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HERPUD2Q9BSE4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HERPUD2Q9BSE4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HERPUD2Q9BSE4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HERPUD2Q9BSE4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HERPUD2Q9BSE4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HERPUD2Q9BSE4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERPUD2Q9BSE4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERPUD2Q9BSE4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERPUD2Q9BSE4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERPUD2Q9BSE4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERPUD2Q9BSE4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERPUD2Q9BSE4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERPUD2Q9BSE4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERPUD2Q9BSE4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERPUD2Q9BSE4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HERPUD2Q9BSE4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERPUD2Q9BSE4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERPUD2Q9BSE4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HERPUD2Q9BSE4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERPUD2Q9BSE4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERPUD2Q9BSE4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERPUD2Q9BSE4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERPUD2Q9BSE4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERPUD2Q9BSE4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HERPUD2Q9BSE4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERPUD2Q9BSE4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HERPUD2Q9BSE4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HERPUD2Q9BSE4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HERPUD2Q9BSE4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERPUD2Q9BSE4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERPUD2Q9BSE4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERPUD2Q9BSE4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERPUD2Q9BSE4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERPUD2Q9BSE4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERPUD2Q9BSE4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERPUD2Q9BSE4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERPUD2Q9BSE4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERPUD2Q9BSE4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERPUD2Q9BSE4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERPUD2Q9BSE4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HERPUD2Q9BSE4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HERPUD2Q9BSE4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERPUD2Q9BSE4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERPUD2Q9BSE4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERPUD2Q9BSE4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.2 ms