Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 GLMP-208ENST00000481050 684 ntTSL 316.54■□□□□ 0.244e-8■■■■■ 36.4
LARP4Q71RC2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.214e-8■■■■■ 36.4
LARP4Q71RC2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.044e-8■■■■■ 36.4
LARP4Q71RC2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.014e-8■■■■■ 36.4
LARP4Q71RC2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.014e-8■■■■■ 36.4
LARP4Q71RC2 GLMP-203ENST00000461597 658 ntTSL 314.48□□□□□ -0.094e-8■■■■■ 36.4
LARP4Q71RC2 GLMP-204ENST00000472870 1188 ntTSL 512.97□□□□□ -0.334e-8■■■■■ 36.4
LARP4Q71RC2 GLMP-209ENST00000482579 572 ntTSL 310.86□□□□□ -0.674e-8■■■■■ 36.4
LARP4Q71RC2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.695e-7■■■■■ 36.3
LARP4Q71RC2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.65e-7■■■■■ 36.3
LARP4Q71RC2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 05e-7■■■■■ 36.3
LARP4Q71RC2 DLGAP4-203ENST00000373907 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.475e-7■■■■■ 36.3
LARP4Q71RC2 RPS26-202ENST00000548590 1204 ntTSL 58.79□□□□□ -11e-8■■■■■ 36.3
LARP4Q71RC2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.268e-11■■■■■ 36.2
LARP4Q71RC2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.719e-7■■■■■ 36.2
LARP4Q71RC2 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.259e-7■■■■■ 36.2
LARP4Q71RC2 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.329e-7■■■■■ 36.2
LARP4Q71RC2 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.389e-7■■■■■ 36.2
LARP4Q71RC2 TMEM9-208ENST00000472411 2892 ntTSL 210.69□□□□□ -0.79e-7■■■■■ 36.2
LARP4Q71RC2 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.545e-7■■■■■ 36.1
LARP4Q71RC2 LINC01033-203ENST00000517934 306 ntTSL 22.1□□□□□ -2.075e-7■■■■■ 36.1
LARP4Q71RC2 THYN1-202ENST00000352327 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.633e-8■■■■■ 36.1
LARP4Q71RC2 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.713e-8■■■■■ 36.1
LARP4Q71RC2 THYN1-204ENST00000392595 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.773e-8■■■■■ 36.1
LARP4Q71RC2 THYN1-201ENST00000341541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.773e-8■■■■■ 36.1
LARP4Q71RC2 NDUFB3-203ENST00000450023 462 ntTSL 36.4□□□□□ -1.384e-8■■■■■ 35.9
LARP4Q71RC2 COX7A2-203ENST00000377978 366 ntTSL 56.51□□□□□ -1.375e-11■■■■■ 35.8
LARP4Q71RC2 CTSH-215ENST00000534237 691 ntTSL 310.34□□□□□ -0.753e-16■■■■■ 35.8
LARP4Q71RC2 HIP1-204ENST00000434438 7066 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.928e-8■■■■■ 35.8
LARP4Q71RC2 HIP1-201ENST00000336926 8013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.058e-8■■■■■ 35.8
LARP4Q71RC2 HIP1-206ENST00000485723 419 ntTSL 27.88□□□□□ -1.158e-8■■■■■ 35.8
LARP4Q71RC2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 35.7
LARP4Q71RC2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.294e-7■■■■■ 35.7
LARP4Q71RC2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 35.7
LARP4Q71RC2 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 35.7
LARP4Q71RC2 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.314e-7■■■■■ 35.7
LARP4Q71RC2 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 35.7
LARP4Q71RC2 PDLIM1-202ENST00000477757 850 ntTSL 218.14■□□□□ 0.499e-10■■■■■ 35.7
LARP4Q71RC2 PDLIM1-204ENST00000492511 453 ntTSL 26.59□□□□□ -1.359e-10■■■■■ 35.7
LARP4Q71RC2 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.338e-12■■■■■ 35.7
LARP4Q71RC2 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.448e-12■■■■■ 35.7
LARP4Q71RC2 MT1F-202ENST00000564295 1573 nt17.53■□□□□ 0.45e-8■■■■■ 35.6
LARP4Q71RC2 MT1F-201ENST00000334350 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.375e-8■■■■■ 35.6
LARP4Q71RC2 MT1F-204ENST00000568475 416 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.665e-8■■■■■ 35.6
LARP4Q71RC2 MAGI1-205ENST00000464060 2247 ntTSL 1 (best)23.53■■□□□ 1.367e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.337e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.17e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 TBC1D22A-204ENST00000394449 2048 ntTSL 521.24■□□□□ 0.997e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.997e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.991e-18■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CD58-204ENST00000464088 874 ntTSL 1 (best)19.4■□□□□ 0.77e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.681e-18■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.677e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.657e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.657e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 P2RX1-202ENST00000571637 1126 ntTSL 1 (best)19.02■□□□□ 0.647e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.637e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.567e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.545e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 AMDHD2-210ENST00000565570 1844 ntTSL 518.1■□□□□ 0.497e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.367e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CORO1C-216ENST00000551059 474 ntTSL 217.2■□□□□ 0.347e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 RRP1-202ENST00000471909 2544 ntTSL 1 (best)17.19■□□□□ 0.347e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.316e-8■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CORO1C-219ENST00000552871 587 ntTSL 316.73■□□□□ 0.277e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CORO1C-210ENST00000549384 891 ntTSL 516.73■□□□□ 0.277e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CORO1C-214ENST00000550542 1245 ntTSL 516.64■□□□□ 0.257e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.175e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CDK8-205ENST00000536792 3032 ntTSL 1 (best)16.02■□□□□ 0.156e-8■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.154e-12■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.157e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.121e-18■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.11e-18■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.17e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.097e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 RRP1-201ENST00000467112 3019 ntTSL 1 (best)15.01□□□□□ -0.017e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.013e-8■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 GATD1-207ENST00000526650 457 ntTSL 314.96□□□□□ -0.013e-8■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.047e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.057e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 GATD1-204ENST00000465313 446 ntTSL 314.7□□□□□ -0.063e-8■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 HDAC6-220ENST00000477528 4832 ntTSL 1 (best)14.26□□□□□ -0.137e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.133e-8■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 P2RX1-203ENST00000572418 2945 ntTSL 214.08□□□□□ -0.167e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CEP250-204ENST00000422671 2648 ntTSL 513.97□□□□□ -0.177e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.197e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 TBC1D22A-207ENST00000441162 2636 ntTSL 213.74□□□□□ -0.217e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.227e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.257e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 GATD1-208ENST00000528309 510 ntTSL 313.36□□□□□ -0.273e-8■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.317e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.337e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 RABGAP1L-209ENST00000457696 1847 ntTSL 1 (best)12.94□□□□□ -0.347e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.357e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.357e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.427e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 DLEU1-203ENST00000461527 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.437e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.477e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.481e-18■■■■■ 35.5
Retrieved 100 of 15,922 protein–RNA pairs in 319 ms