Protein–RNA interactions for Protein: Q14151

SAFB2, Scaffold attachment factor B2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFB2Q14151 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.263e-6■■■■□ 20.3
SAFB2Q14151 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.232e-6■■■■□ 20.3
SAFB2Q14151 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.712e-6■■■■□ 20.3
SAFB2Q14151 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.872e-6■■■■□ 20.2
SAFB2Q14151 AC015574.1-203ENST00000614344 498 ntTSL 56.56□□□□□ -1.362e-6■■■■□ 20.2
SAFB2Q14151 AC015574.1-204ENST00000612595 512 ntTSL 56□□□□□ -1.452e-6■■■■□ 20.2
SAFB2Q14151 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.163e-6■■■■□ 20.2
SAFB2Q14151 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.321e-6■■■■□ 20.2
SAFB2Q14151 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.821e-6■■■■□ 20.2
SAFB2Q14151 DNAH14-211ENST00000445597 10524 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 20.2
SAFB2Q14151 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.351e-6■■■■□ 20.2
SAFB2Q14151 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.688e-7■■■■□ 20.1
SAFB2Q14151 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.758e-7■■■■□ 20.1
SAFB2Q14151 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.838e-7■■■■□ 20.1
SAFB2Q14151 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.938e-7■■■■□ 20.1
SAFB2Q14151 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.148e-7■■■■□ 20.1
SAFB2Q14151 Z98749.2-206ENST00000381645 938 ntTSL 230.67■■■□□ 2.52e-6■■■■□ 20.1
SAFB2Q14151 Z98749.2-209ENST00000455209 792 ntTSL 324.49■■□□□ 1.512e-6■■■■□ 20.1
SAFB2Q14151 Z98749.2-203ENST00000407491 574 ntTSL 324.31■■□□□ 1.482e-6■■■■□ 20.1
SAFB2Q14151 Z98749.2-204ENST00000443042 579 ntTSL 423.71■■□□□ 1.392e-6■■■■□ 20.1
SAFB2Q14151 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.292e-6■■■■□ 20.1
SAFB2Q14151 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.242e-6■■■■□ 20.1
SAFB2Q14151 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 20.1
SAFB2Q14151 Z98749.2-205ENST00000457665 974 ntTSL 221.1■□□□□ 0.972e-6■■■■□ 20.1
SAFB2Q14151 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.56□□□□□ -1.842e-6■■■■□ 20.1
SAFB2Q14151 MMS22L-209ENST00000509383 3083 ntTSL 1 (best)12.36□□□□□ -0.439e-7■■■■□ 20.1
SAFB2Q14151 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.019e-7■■■■□ 20.1
SAFB2Q14151 MMS22L-210ENST00000510018 966 ntTSL 56.96□□□□□ -1.39e-7■■■■□ 20.1
SAFB2Q14151 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.599e-7■■■■□ 20.1
SAFB2Q14151 PRR4-213ENST00000546265 534 ntTSL 516.89■□□□□ 0.294e-6■■■■□ 20.1
SAFB2Q14151 PRR4-208ENST00000541175 384 ntTSL 29.52□□□□□ -0.894e-6■■■■□ 20.1
SAFB2Q14151 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.371e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.91e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.671e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 MSI2-210ENST00000579505 577 ntTSL 325.33■■□□□ 1.652e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.492e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.072e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.062e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 MSI2-207ENST00000579205 500 ntTSL 420.54■□□□□ 0.882e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.832e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.742e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 MSI2-216ENST00000582772 398 ntTSL 37.79□□□□□ -1.162e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 MSI2-215ENST00000582453 496 ntTSL 34.23□□□□□ -1.732e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 PITX1-206ENST00000507253 587 ntTSL 334.04■■■■□ 3.042e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 PITX1-202ENST00000502676 666 ntTSL 333.55■■■□□ 2.962e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.532e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.522e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 PTP4A3-205ENST00000523147 558 ntTSL 530.5■■■□□ 2.472e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.392e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 EHMT1-224ENST00000630754 709 ntTSL 328.18■■■□□ 2.12e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.032e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.782e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.732e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.542e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 EHMT1-202ENST00000460486 818 ntTSL 524.66■■□□□ 1.542e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.532e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.148e-7■■■■□ 20
SAFB2Q14151 EHMT1-220ENST00000626216 558 ntTSL 320.25■□□□□ 0.832e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.828e-7■■■■□ 20
SAFB2Q14151 EHMT1-222ENST00000629417 882 ntTSL 316.5■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 EHMT1-215ENST00000492232 710 ntTSL 316.4■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 MAST2-202ENST00000372008 2528 ntTSL 515.39■□□□□ 0.052e-6■■■■□ 20
SAFB2Q14151 SAMD4A-207ENST00000555112 2287 ntTSL 1 (best)27.37■■□□□ 1.971e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.894e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 CHCHD3-202ENST00000423635 1310 ntTSL 1 (best)24.95■■□□□ 1.584e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.364e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 RAB3GAP2-201ENST00000237724 821 ntTSL 323.08■■□□□ 1.294e-8■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.051e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.791e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.41e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 KCNJ15-217ENST00000549805 740 ntTSL 317.06■□□□□ 0.321e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.31e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.241e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 KCNJ15-216ENST00000549158 626 ntTSL 315.2■□□□□ 0.021e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 KCNJ15-213ENST00000547341 595 ntTSL 315.2■□□□□ 0.021e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 RAB3GAP2-204ENST00000474178 539 ntTSL 415.06■□□□□ 04e-8■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 KCNJ15-219ENST00000551422 413 ntTSL 214.5□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 KCNJ15-214ENST00000547595 313 ntTSL 214.5□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 KCNJ15-218ENST00000549932 555 ntTSL 214.44□□□□□ -0.11e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 KCNJ15-215ENST00000548700 304 ntTSL 314.29□□□□□ -0.121e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 RAB3GAP2-202ENST00000358951 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.194e-8■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 RAB3GAP2-207ENST00000478976 575 ntTSL 413.64□□□□□ -0.234e-8■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 RAB3GAP2-203ENST00000462353 1906 ntTSL 1 (best)13.43□□□□□ -0.264e-8■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 RAB3GAP2-206ENST00000475769 375 ntTSL 312.21□□□□□ -0.454e-8■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 RNF216-209ENST00000484458 492 ntTSL 511.23□□□□□ -0.611e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 RNF216-201ENST00000389900 3104 ntTSL 1 (best)10.89□□□□□ -0.671e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 CHCHD3-206ENST00000496427 721 ntTSL 510.4□□□□□ -0.744e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 DSCR8-205ENST00000472602 766 ntTSL 39.61□□□□□ -0.871e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC7.99□□□□□ -1.134e-8■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 MCM3AP-AS1-209ENST00000591223 572 ntTSL 421.34■■□□□ 1.012e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 MCM3AP-AS1-205ENST00000444998 2193 ntTSL 28.21□□□□□ -1.092e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.262e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 MCM3AP-AS1-207ENST00000588753 589 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.411e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 SCLT1-202ENST00000439369 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.421e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 SCLT1-201ENST00000281142 3055 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 19.9
SAFB2Q14151 MCM3AP-AS1-208ENST00000590829 703 ntTSL 423.92■■□□□ 1.422e-6■■■■□ 19.8
Retrieved 100 of 3,296 protein–RNA pairs in 341.4 ms