Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 ELO1YJL196C 933 nt10.09□□□□□ -0.79
HRQ1Q05549 SNZ1YMR096W 894 nt10.09□□□□□ -0.79
HRQ1Q05549 CYT1YOR065W 930 nt10.09□□□□□ -0.79
HRQ1Q05549 RRT8YOL048C 1029 nt10.08□□□□□ -0.8
HRQ1Q05549 VMA11YPL234C 495 nt10.08□□□□□ -0.8
HRQ1Q05549 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt10.07□□□□□ -0.8
HRQ1Q05549 ADE8YDR408C 645 nt10.05□□□□□ -0.8
HRQ1Q05549 SNX3YOR357C 489 nt10.05□□□□□ -0.8
HRQ1Q05549 DAK2YFL053W 1776 nt10.03□□□□□ -0.8
HRQ1Q05549 DPL1YDR294C 1770 nt10.02□□□□□ -0.81
HRQ1Q05549 OPI3YJR073C 621 nt10.02□□□□□ -0.81
HRQ1Q05549 YJR114WYJR114W 393 nt10.02□□□□□ -0.81
HRQ1Q05549 YMR262WYMR262W 942 nt10.01□□□□□ -0.81
HRQ1Q05549 RPC31YNL151C 756 nt10.01□□□□□ -0.81
HRQ1Q05549 YNR064CYNR064C 873 nt10□□□□□ -0.81
HRQ1Q05549 RPM1RPM1 483 nt9.99□□□□□ -0.81
HRQ1Q05549 RIM2YBR192W 1134 nt9.99□□□□□ -0.81
HRQ1Q05549 YHL008CYHL008C 1884 nt9.99□□□□□ -0.81
HRQ1Q05549 SUV3YPL029W 2214 nt9.98□□□□□ -0.81
HRQ1Q05549 YPR126CYPR126C 309 nt9.97□□□□□ -0.81
HRQ1Q05549 YMR265CYMR265C 1386 nt9.97□□□□□ -0.81
HRQ1Q05549 SFL1YOR140W 2301 nt9.95□□□□□ -0.82
HRQ1Q05549 AGP3YFL055W 1677 nt9.94□□□□□ -0.82
HRQ1Q05549 LEU4YNL104C 1860 nt9.93□□□□□ -0.82
HRQ1Q05549 CCT5YJR064W 1689 nt9.93□□□□□ -0.82
HRQ1Q05549 YJL195CYJL195C 702 nt9.93□□□□□ -0.82
HRQ1Q05549 HAP5YOR358W 729 nt9.93□□□□□ -0.82
HRQ1Q05549 CSM2YIL132C 642 nt9.92□□□□□ -0.82
HRQ1Q05549 KEL3YPL263C 1956 nt9.92□□□□□ -0.82
HRQ1Q05549 TVP23YDR084C 600 nt9.91□□□□□ -0.82
HRQ1Q05549 SPS100YHR139C 981 nt9.91□□□□□ -0.82
HRQ1Q05549 CTI6YPL181W 1521 nt9.91□□□□□ -0.82
HRQ1Q05549 CRC1YOR100C 984 nt9.9□□□□□ -0.82
HRQ1Q05549 MET1YKR069W 1782 nt9.88□□□□□ -0.83
HRQ1Q05549 IML3YBR107C 738 nt9.86□□□□□ -0.83
HRQ1Q05549 THI72YOR192C 1800 nt9.85□□□□□ -0.83
HRQ1Q05549 SWT21YNL187W 1074 nt9.85□□□□□ -0.83
HRQ1Q05549 KRR1YCL059C 951 nt9.84□□□□□ -0.83
HRQ1Q05549 YKL053WYKL053W 375 nt9.84□□□□□ -0.83
HRQ1Q05549 RPN14YGL004C 1254 nt9.83□□□□□ -0.84
HRQ1Q05549 NPP2YEL016C 1482 nt9.83□□□□□ -0.84
HRQ1Q05549 ABZ2YMR289W 1125 nt9.82□□□□□ -0.84
HRQ1Q05549 YDR467CYDR467C 327 nt9.81□□□□□ -0.84
HRQ1Q05549 KGD2YDR148C 1392 nt9.8□□□□□ -0.84
HRQ1Q05549 FUN14YAL008W 597 nt9.8□□□□□ -0.84
HRQ1Q05549 MET2YNL277W 1461 nt9.79□□□□□ -0.84
HRQ1Q05549 TPO4YOR273C 1980 nt9.79□□□□□ -0.84
HRQ1Q05549 INH1YDL181W 258 nt9.79□□□□□ -0.84
HRQ1Q05549 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.79□□□□□ -0.84
HRQ1Q05549 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.79□□□□□ -0.84
HRQ1Q05549 ENO2YHR174W 1314 nt9.79□□□□□ -0.84
HRQ1Q05549 MET8YBR213W 825 nt9.78□□□□□ -0.84
HRQ1Q05549 AMF1YOR378W 1548 nt9.77□□□□□ -0.84
HRQ1Q05549 PCP1YGR101W 1041 nt9.77□□□□□ -0.85
HRQ1Q05549 snR31snR31 225 nt9.77□□□□□ -0.85
HRQ1Q05549 YEL008WYEL008W 381 nt9.76□□□□□ -0.85
HRQ1Q05549 TPC1YGR096W 945 nt9.76□□□□□ -0.85
HRQ1Q05549 NBA1YOL070C 1506 nt9.76□□□□□ -0.85
HRQ1Q05549 FET5YFL041W 1869 nt9.75□□□□□ -0.85
HRQ1Q05549 MHF1YOL086W-A 273 nt9.75□□□□□ -0.85
HRQ1Q05549 SFP1YLR403W 2052 nt9.73□□□□□ -0.85
HRQ1Q05549 GPM1YKL152C 744 nt9.73□□□□□ -0.85
HRQ1Q05549 THI3YDL080C 1830 nt9.72□□□□□ -0.85
HRQ1Q05549 SAN1YDR143C 1833 nt9.7□□□□□ -0.86
HRQ1Q05549 POT1YIL160C 1254 nt9.69□□□□□ -0.86
HRQ1Q05549 TRP2YER090W 1524 nt9.68□□□□□ -0.86
HRQ1Q05549 TAF13YML098W 504 nt9.68□□□□□ -0.86
HRQ1Q05549 MTO1YGL236C 2010 nt9.68□□□□□ -0.86
HRQ1Q05549 NAM8YHR086W 1572 nt9.67□□□□□ -0.86
HRQ1Q05549 APS2YJR058C 444 nt9.66□□□□□ -0.86
HRQ1Q05549 YBL095WYBL095W 813 nt9.66□□□□□ -0.86
HRQ1Q05549 ALD5YER073W 1563 nt9.66□□□□□ -0.86
HRQ1Q05549 AAT1YKL106W 1356 nt9.65□□□□□ -0.86
HRQ1Q05549 NIF3YGL221C 867 nt9.65□□□□□ -0.86
HRQ1Q05549 HMG2YLR450W 3138 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 GGA2YHR108W 1758 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 SBP1YHL034C 885 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 YMC2YBR104W 990 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 LEU2YCL018W 1095 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 HXK1YFR053C 1458 nt9.63□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 SPE2YOL052C 1191 nt9.62□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 YOR072WYOR072W 315 nt9.62□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 THI6YPL214C 1623 nt9.62□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 SRP54YPR088C 1626 nt9.62□□□□□ -0.87
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