Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 NIF3YGL221C 867 nt10.97□□□□□ -0.65
HEF3P53978 YJR114WYJR114W 393 nt10.96□□□□□ -0.65
HEF3P53978 ITR2YOL103W 1830 nt10.95□□□□□ -0.66
HEF3P53978 MRS6YOR370C 1812 nt10.95□□□□□ -0.66
HEF3P53978 ELO1YJL196C 933 nt10.94□□□□□ -0.66
HEF3P53978 YBR232CYBR232C 360 nt10.93□□□□□ -0.66
HEF3P53978 SGA1YIL099W 1650 nt10.92□□□□□ -0.66
HEF3P53978 TVP23YDR084C 600 nt10.91□□□□□ -0.66
HEF3P53978 STP3YLR375W 1032 nt10.91□□□□□ -0.66
HEF3P53978 LSR1LSR1 1175 nt10.91□□□□□ -0.66
HEF3P53978 ABZ2YMR289W 1125 nt10.91□□□□□ -0.66
HEF3P53978 TUB4YLR212C 1422 nt10.91□□□□□ -0.66
HEF3P53978 YHR219WYHR219W 1875 nt10.9□□□□□ -0.66
HEF3P53978 DLD3YEL071W 1491 nt10.9□□□□□ -0.66
HEF3P53978 ENT4YLL038C 744 nt10.9□□□□□ -0.66
HEF3P53978 SEN2YLR105C 1134 nt10.9□□□□□ -0.66
HEF3P53978 YKL133CYKL133C 1392 nt10.89□□□□□ -0.67
HEF3P53978 NAS2YIL007C 663 nt10.88□□□□□ -0.67
HEF3P53978 GSF2YML048W 1212 nt10.88□□□□□ -0.67
HEF3P53978 YNR064CYNR064C 873 nt10.88□□□□□ -0.67
HEF3P53978 UGP1YKL035W 1500 nt10.88□□□□□ -0.67
HEF3P53978 HSL7YBR133C 2484 nt10.86□□□□□ -0.67
HEF3P53978 ZAP1YJL056C 2643 nt10.85□□□□□ -0.67
HEF3P53978 SPE2YOL052C 1191 nt10.84□□□□□ -0.67
HEF3P53978 ENO2YHR174W 1314 nt10.84□□□□□ -0.67
HEF3P53978 TPC1YGR096W 945 nt10.83□□□□□ -0.68
HEF3P53978 CDD1YLR245C 429 nt10.83□□□□□ -0.68
HEF3P53978 YJL064WYJL064W 396 nt10.82□□□□□ -0.68
HEF3P53978 KRE1YNL322C 942 nt10.81□□□□□ -0.68
HEF3P53978 TIP1YBR067C 633 nt10.81□□□□□ -0.68
HEF3P53978 SFL1YOR140W 2301 nt10.8□□□□□ -0.68
HEF3P53978 IGD1YFR017C 588 nt10.77□□□□□ -0.69
HEF3P53978 AMF1YOR378W 1548 nt10.77□□□□□ -0.69
HEF3P53978 SUV3YPL029W 2214 nt10.76□□□□□ -0.69
HEF3P53978 PAR32YDL173W 888 nt10.76□□□□□ -0.69
HEF3P53978 HIS2YFR025C 1008 nt10.76□□□□□ -0.69
HEF3P53978 RIM8YGL045W 1629 nt10.76□□□□□ -0.69
HEF3P53978 PCP1YGR101W 1041 nt10.75□□□□□ -0.69
HEF3P53978 PUP1YOR157C 786 nt10.74□□□□□ -0.69
HEF3P53978 MET1YKR069W 1782 nt10.73□□□□□ -0.69
HEF3P53978 YKL053WYKL053W 375 nt10.73□□□□□ -0.69
HEF3P53978 SWT21YNL187W 1074 nt10.73□□□□□ -0.69
HEF3P53978 KEL3YPL263C 1956 nt10.73□□□□□ -0.69
HEF3P53978 PAU19YMR325W 375 nt10.72□□□□□ -0.69
HEF3P53978 VMA11YPL234C 495 nt10.71□□□□□ -0.69
HEF3P53978 CRC1YOR100C 984 nt10.7□□□□□ -0.7
HEF3P53978 YMR265CYMR265C 1386 nt10.69□□□□□ -0.7
HEF3P53978 ADH3YMR083W 1128 nt10.69□□□□□ -0.7
HEF3P53978 NAM8YHR086W 1572 nt10.69□□□□□ -0.7
HEF3P53978 THP3YPR045C 1413 nt10.68□□□□□ -0.7
HEF3P53978 RPD3YNL330C 1302 nt10.68□□□□□ -0.7
HEF3P53978 SNX3YOR357C 489 nt10.68□□□□□ -0.7
HEF3P53978 HAP5YOR358W 729 nt10.68□□□□□ -0.7
HEF3P53978 SSL2YIL143C 2532 nt10.68□□□□□ -0.7
HEF3P53978 NAP1YKR048C 1254 nt10.67□□□□□ -0.7
HEF3P53978 ODC1YPL134C 933 nt10.67□□□□□ -0.7
HEF3P53978 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt10.66□□□□□ -0.7
HEF3P53978 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt10.66□□□□□ -0.7
HEF3P53978 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt10.66□□□□□ -0.7
HEF3P53978 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt10.66□□□□□ -0.7
HEF3P53978 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt10.66□□□□□ -0.7
HEF3P53978 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt10.66□□□□□ -0.7
HEF3P53978 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt10.66□□□□□ -0.7
HEF3P53978 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt10.66□□□□□ -0.7
HEF3P53978 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt10.66□□□□□ -0.7
HEF3P53978 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt10.66□□□□□ -0.7
HEF3P53978 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt10.66□□□□□ -0.7
HEF3P53978 PHB2YGR231C 933 nt10.66□□□□□ -0.7
HEF3P53978 RIM2YBR192W 1134 nt10.65□□□□□ -0.7
HEF3P53978 YMR209CYMR209C 1374 nt10.65□□□□□ -0.71
HEF3P53978 YKR012CYKR012C 378 nt10.64□□□□□ -0.71
HEF3P53978 SLG1YOR008C 1137 nt10.64□□□□□ -0.71
HEF3P53978 LEU2YCL018W 1095 nt10.63□□□□□ -0.71
HEF3P53978 YGL114WYGL114W 2178 nt10.61□□□□□ -0.71
HEF3P53978 TIM44YIL022W 1296 nt10.61□□□□□ -0.71
HEF3P53978 IPL1YPL209C 1104 nt10.61□□□□□ -0.71
HEF3P53978 MOB1YIL106W 945 nt10.59□□□□□ -0.71
HEF3P53978 KGD2YDR148C 1392 nt10.58□□□□□ -0.72
HEF3P53978 FLX1YIL134W 936 nt10.58□□□□□ -0.72
HEF3P53978 YCR025CYCR025C 411 nt10.55□□□□□ -0.72
HEF3P53978 REX2YLR059C 810 nt10.55□□□□□ -0.72
HEF3P53978 snR31snR31 225 nt10.55□□□□□ -0.72
HEF3P53978 SRP54YPR088C 1626 nt10.55□□□□□ -0.72
HEF3P53978 SAN1YDR143C 1833 nt10.54□□□□□ -0.72
HEF3P53978 RPN14YGL004C 1254 nt10.54□□□□□ -0.72
HEF3P53978 FSH2YMR222C 672 nt10.54□□□□□ -0.72
HEF3P53978 RPC31YNL151C 756 nt10.54□□□□□ -0.72
HEF3P53978 DPL1YDR294C 1770 nt10.54□□□□□ -0.72
HEF3P53978 SDS24YBR214W 1584 nt10.53□□□□□ -0.72
HEF3P53978 ACO2YJL200C 2370 nt10.52□□□□□ -0.73
HEF3P53978 CWP2YKL096W-A 279 nt10.51□□□□□ -0.73
HEF3P53978 LYS20YDL182W 1287 nt10.5□□□□□ -0.73
HEF3P53978 VBA3YCL069W 1377 nt10.49□□□□□ -0.73
HEF3P53978 MDM35YKL053C-A 261 nt10.46□□□□□ -0.73
HEF3P53978 TGA1tA(UGC)A 73 nt10.44□□□□□ -0.74
HEF3P53978 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt10.44□□□□□ -0.74
HEF3P53978 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt10.44□□□□□ -0.74
HEF3P53978 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt10.44□□□□□ -0.74
HEF3P53978 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt10.44□□□□□ -0.74
HEF3P53978 DMA2YNL116W 1569 nt10.43□□□□□ -0.74
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