Protein–RNA interactions for Protein: P39959

YER130C, Zinc finger protein YER130C, yeastyeast

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YER130CP39959 ELO1YJL196C 933 nt9.81□□□□□ -0.84
YER130CP39959 MDM35YKL053C-A 261 nt9.81□□□□□ -0.84
YER130CP39959 TIP1YBR067C 633 nt9.81□□□□□ -0.84
YER130CP39959 YPR126CYPR126C 309 nt9.81□□□□□ -0.84
YER130CP39959 CCT5YJR064W 1689 nt9.8□□□□□ -0.84
YER130CP39959 TIM44YIL022W 1296 nt9.79□□□□□ -0.84
YER130CP39959 OPI3YJR073C 621 nt9.79□□□□□ -0.84
YER130CP39959 YJR114WYJR114W 393 nt9.79□□□□□ -0.84
YER130CP39959 YHR218WYHR218W 1812 nt9.79□□□□□ -0.84
YER130CP39959 YNR064CYNR064C 873 nt9.78□□□□□ -0.84
YER130CP39959 SNX3YOR357C 489 nt9.77□□□□□ -0.85
YER130CP39959 HXT10YFL011W 1641 nt9.76□□□□□ -0.85
YER130CP39959 SUV3YPL029W 2214 nt9.74□□□□□ -0.85
YER130CP39959 DPL1YDR294C 1770 nt9.74□□□□□ -0.85
YER130CP39959 YMR262WYMR262W 942 nt9.74□□□□□ -0.85
YER130CP39959 RPC31YNL151C 756 nt9.73□□□□□ -0.85
YER130CP39959 CYT1YOR065W 930 nt9.73□□□□□ -0.85
YER130CP39959 CTI6YPL181W 1521 nt9.72□□□□□ -0.85
YER130CP39959 YMR265CYMR265C 1386 nt9.72□□□□□ -0.85
YER130CP39959 SFL1YOR140W 2301 nt9.72□□□□□ -0.85
YER130CP39959 TVP23YDR084C 600 nt9.71□□□□□ -0.86
YER130CP39959 SPS100YHR139C 981 nt9.71□□□□□ -0.86
YER130CP39959 FUN14YAL008W 597 nt9.71□□□□□ -0.86
YER130CP39959 RIM2YBR192W 1134 nt9.71□□□□□ -0.86
YER130CP39959 THI72YOR192C 1800 nt9.69□□□□□ -0.86
YER130CP39959 HAP5YOR358W 729 nt9.69□□□□□ -0.86
YER130CP39959 KEL3YPL263C 1956 nt9.68□□□□□ -0.86
YER130CP39959 IML3YBR107C 738 nt9.68□□□□□ -0.86
YER130CP39959 YEL008WYEL008W 381 nt9.67□□□□□ -0.86
YER130CP39959 AGP3YFL055W 1677 nt9.64□□□□□ -0.87
YER130CP39959 YHL008CYHL008C 1884 nt9.64□□□□□ -0.87
YER130CP39959 SWT21YNL187W 1074 nt9.64□□□□□ -0.87
YER130CP39959 CRC1YOR100C 984 nt9.64□□□□□ -0.87
YER130CP39959 LEU4YNL104C 1860 nt9.64□□□□□ -0.87
YER130CP39959 MET1YKR069W 1782 nt9.63□□□□□ -0.87
YER130CP39959 KRR1YCL059C 951 nt9.62□□□□□ -0.87
YER130CP39959 ABZ2YMR289W 1125 nt9.62□□□□□ -0.87
YER130CP39959 MHF1YOL086W-A 273 nt9.61□□□□□ -0.87
YER130CP39959 RPN14YGL004C 1254 nt9.6□□□□□ -0.87
YER130CP39959 PCP1YGR101W 1041 nt9.58□□□□□ -0.88
YER130CP39959 AMF1YOR378W 1548 nt9.56□□□□□ -0.88
YER130CP39959 YKL053WYKL053W 375 nt9.56□□□□□ -0.88
YER130CP39959 POT1YIL160C 1254 nt9.55□□□□□ -0.88
YER130CP39959 TAF13YML098W 504 nt9.55□□□□□ -0.88
YER130CP39959 RPM1RPM1 483 nt9.55□□□□□ -0.88
YER130CP39959 snR31snR31 225 nt9.55□□□□□ -0.88
YER130CP39959 ENO2YHR174W 1314 nt9.55□□□□□ -0.88
YER130CP39959 YLR349WYLR349W 507 nt9.54□□□□□ -0.88
YER130CP39959 STE4YOR212W 1272 nt9.54□□□□□ -0.88
YER130CP39959 KGD2YDR148C 1392 nt9.53□□□□□ -0.88
YER130CP39959 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.52□□□□□ -0.89
YER130CP39959 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.52□□□□□ -0.89
YER130CP39959 YDR467CYDR467C 327 nt9.52□□□□□ -0.89
YER130CP39959 NPP2YEL016C 1482 nt9.52□□□□□ -0.89
YER130CP39959 INH1YDL181W 258 nt9.51□□□□□ -0.89
YER130CP39959 TPC1YGR096W 945 nt9.51□□□□□ -0.89
YER130CP39959 NIF3YGL221C 867 nt9.5□□□□□ -0.89
YER130CP39959 APS2YJR058C 444 nt9.49□□□□□ -0.89
YER130CP39959 SAN1YDR143C 1833 nt9.48□□□□□ -0.89
YER130CP39959 RAD51YER095W 1203 nt9.47□□□□□ -0.89
YER130CP39959 THI3YDL080C 1830 nt9.47□□□□□ -0.89
YER130CP39959 NBA1YOL070C 1506 nt9.46□□□□□ -0.89
YER130CP39959 GPM1YKL152C 744 nt9.46□□□□□ -0.9
YER130CP39959 FET5YFL041W 1869 nt9.46□□□□□ -0.9
YER130CP39959 TPO4YOR273C 1980 nt9.46□□□□□ -0.9
YER130CP39959 CPD1YGR247W 720 nt9.45□□□□□ -0.9
YER130CP39959 NAM8YHR086W 1572 nt9.44□□□□□ -0.9
YER130CP39959 TUB4YLR212C 1422 nt9.43□□□□□ -0.9
YER130CP39959 LEU2YCL018W 1095 nt9.43□□□□□ -0.9
YER130CP39959 NAS2YIL007C 663 nt9.42□□□□□ -0.9
YER130CP39959 SBP1YHL034C 885 nt9.41□□□□□ -0.9
YER130CP39959 GSF2YML048W 1212 nt9.41□□□□□ -0.9
YER130CP39959 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt9.41□□□□□ -0.9
YER130CP39959 CDD1YLR245C 429 nt9.4□□□□□ -0.9
YER130CP39959 YBL095WYBL095W 813 nt9.4□□□□□ -0.9
YER130CP39959 SRP54YPR088C 1626 nt9.4□□□□□ -0.9
YER130CP39959 SPE2YOL052C 1191 nt9.39□□□□□ -0.91
YER130CP39959 GGA2YHR108W 1758 nt9.39□□□□□ -0.91
YER130CP39959 MTO1YGL236C 2010 nt9.38□□□□□ -0.91
YER130CP39959 ADH7YCR105W 1086 nt9.36□□□□□ -0.91
YER130CP39959 REX2YLR059C 810 nt9.36□□□□□ -0.91
YER130CP39959 TRP2YER090W 1524 nt9.36□□□□□ -0.91
YER130CP39959 AAT1YKL106W 1356 nt9.35□□□□□ -0.91
YER130CP39959 MET2YNL277W 1461 nt9.34□□□□□ -0.91
YER130CP39959 THP3YPR045C 1413 nt9.34□□□□□ -0.91
YER130CP39959 KRE1YNL322C 942 nt9.33□□□□□ -0.92
YER130CP39959 YMC2YBR104W 990 nt9.33□□□□□ -0.92
YER130CP39959 GAS1YMR307W 1680 nt9.32□□□□□ -0.92
YER130CP39959 THI6YPL214C 1623 nt9.32□□□□□ -0.92
YER130CP39959 PAU15YIR041W 375 nt9.32□□□□□ -0.92
YER130CP39959 SFP1YLR403W 2052 nt9.32□□□□□ -0.92
YER130CP39959 PTC6YCR079W 1329 nt9.31□□□□□ -0.92
YER130CP39959 HXT11YOL156W 1704 nt9.31□□□□□ -0.92
YER130CP39959 PAU5YFL020C 369 nt9.31□□□□□ -0.92
YER130CP39959 ESS1YJR017C 513 nt9.3□□□□□ -0.92
YER130CP39959 PGC1YPL206C 966 nt9.3□□□□□ -0.92
YER130CP39959 HMG2YLR450W 3138 nt9.29□□□□□ -0.92
YER130CP39959 YRF1-2YER190W 5046 nt9.29□□□□□ -0.92
YER130CP39959 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt9.29□□□□□ -0.92
YER130CP39959 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.7 ms