Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP13Q86W25 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP13Q86W25 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms