Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 TIF4631YGR162W 2859 nt4.27□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 FUN12YAL035W 3009 nt4.27□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 KEL2YGR238C 2649 nt4.26□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 IRC3YDR332W 2070 nt4.26□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 KIP3YGL216W 2418 nt4.26□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 AIM9YER080W 1884 nt4.26□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 SSB1YDL229W 1842 nt4.26□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 NUP60YAR002W 1620 nt4.26□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 YPP1YGR198W 2454 nt4.26□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 RPS29BYDL061C 171 nt4.26□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 ALG8YOR067C 1734 nt4.26□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 HOT1YMR172W 2160 nt4.26□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 TOF2YKR010C 2316 nt4.26□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 CCT7YJL111W 1653 nt4.26□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 VPS64YDR200C 1815 nt4.25□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 VPS41YDR080W 2979 nt4.25□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 LSM1YJL124C 519 nt4.25□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 YLR012CYLR012C 300 nt4.25□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 SSE1YPL106C 2082 nt4.25□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 ARO1YDR127W 4767 nt4.25□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 snR60snR60 104 nt4.24□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 YDR426CYDR426C 378 nt4.24□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 MBB1YJL199C 327 nt4.24□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 YKR033CYKR033C 426 nt4.24□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 HHT1YBR010W 411 nt4.24□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 YOR376WYOR376W 369 nt4.24□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 APL4YPR029C 2499 nt4.24□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 TRM44YPL030W 1704 nt4.24□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 SLM2YNL047C 1971 nt4.23□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 TIM12YBR091C 330 nt4.23□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 BRE4YDL231C 3378 nt4.22□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 TIF4632YGL049C 2745 nt4.22□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 PRE4YFR050C 801 nt4.22□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 RPL36AYMR194W 303 nt4.22□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 YPL182CYPL182C 384 nt4.22□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 PEX5YDR244W 1839 nt4.22□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 VHS3YOR054C 2025 nt4.22□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 REV1YOR346W 2958 nt4.22□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 GSC2YGR032W 5688 nt4.22□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 CAF130YGR134W 3369 nt4.22□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 RPO31YOR116C 4383 nt4.21□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 TIM13YGR181W 318 nt4.21□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 YNL028WYNL028W 318 nt4.21□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 MNT3YIL014W 1893 nt4.21□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 MCD4YKL165C 2760 nt4.21□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 snR72snR72 98 nt4.2□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 APC9YLR102C 798 nt4.2□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt4.2□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 snR52snR52 92 nt4.2□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 TPS2YDR074W 2691 nt4.19□□□□□ -1.74
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SRF1Q12516 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.19□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.19□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.19□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 SBH1YER087C-B 249 nt4.19□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.19□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.19□□□□□ -1.74
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SRF1Q12516 SEG1YMR086W 2883 nt4.19□□□□□ -1.74
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SRF1Q12516 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt4.18□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 YRM1YOR172W 2361 nt4.17□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 YML037CYML037C 1023 nt4.17□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 CSE2YNR010W 450 nt4.17□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 CRT10YOL063C 2874 nt4.17□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 ASG1YIL130W 2895 nt4.16□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 YBR184WYBR184W 1572 nt4.16□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 YDR089WYDR089W 2610 nt4.16□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 GAC1YOR178C 2382 nt4.16□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 EMC1YCL045C 2283 nt4.15□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 YSH1YLR277C 2340 nt4.15□□□□□ -1.74
SRF1Q12516 CCW14YLR390W-A 717 nt4.15□□□□□ -1.75
SRF1Q12516 RPS17AYML024W 411 nt4.15□□□□□ -1.75
SRF1Q12516 RLM1YPL089C 2031 nt4.14□□□□□ -1.75
SRF1Q12516 APC11YDL008W 498 nt4.14□□□□□ -1.75
SRF1Q12516 YEL045CYEL045C 426 nt4.14□□□□□ -1.75
SRF1Q12516 DLS1YJL065C 504 nt4.14□□□□□ -1.75
SRF1Q12516 MRPL33YMR286W 261 nt4.14□□□□□ -1.75
SRF1Q12516 HHF1YBR009C 312 nt4.14□□□□□ -1.75
SRF1Q12516 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt4.14□□□□□ -1.75
SRF1Q12516 PDS5YMR076C 3834 nt4.14□□□□□ -1.75
SRF1Q12516 TCO89YPL180W 2400 nt4.13□□□□□ -1.75
SRF1Q12516 ROD1YOR018W 2514 nt4.13□□□□□ -1.75
SRF1Q12516 NCE101YJL205C 162 nt4.13□□□□□ -1.75
SRF1Q12516 GOT1YMR292W 417 nt4.13□□□□□ -1.75
SRF1Q12516 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt4.13□□□□□ -1.75
SRF1Q12516 CDC24YAL041W 2565 nt4.13□□□□□ -1.75
SRF1Q12516 YGR250CYGR250C 2346 nt4.13□□□□□ -1.75
SRF1Q12516 ERB1YMR049C 2424 nt4.13□□□□□ -1.75
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