Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 RGA2YDR379W 3030 nt2.51□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 PDR3YBL005W 2931 nt2.51□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 YIL058WYIL058W 285 nt2.51□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 TPM2YIL138C 486 nt2.51□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 YJL202CYJL202C 348 nt2.51□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 EMC6YLL014W 327 nt2.51□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 CMS1YLR003C 876 nt2.51□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 AIM32YML050W 936 nt2.51□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 PBI2YNL015W 228 nt2.51□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 CRS5YOR031W 210 nt2.51□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.51□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 YBR197CYBR197C 654 nt2.51□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 UTP13YLR222C 2454 nt2.51□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 NEW1YPL226W 3591 nt2.51□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 ASG1YIL130W 2895 nt2.51□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 SHE9YDR393W 1371 nt2.5□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 GPI8YDR331W 1236 nt2.5□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 MXR1YER042W 555 nt2.5□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 RNR4YGR180C 1038 nt2.5□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 RPF1YHR088W 888 nt2.5□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 HYR1YIR037W 492 nt2.5□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.5□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 RPB11YOL005C 363 nt2.5□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 SGS1YMR190C 4344 nt2.5□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 NUM1YDR150W 8247 nt2.5□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 MSB1YOR188W 3414 nt2.5□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 FKS3YMR306W 5358 nt2.5□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 EDS1YBR033W 2760 nt2.49□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 YGR050CYGR050C 357 nt2.49□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.49□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 BET3YKR068C 582 nt2.49□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2.49□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 ATX2YOR079C 942 nt2.49□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 IRC16YPR038W 360 nt2.49□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 snR43snR43 209 nt2.49□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 TRA1YHR099W 11235 nt2.49□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 HRD3YLR207W 2502 nt2.48□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 AMS1YGL156W 3252 nt2.48□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 MDM32YOR147W 1869 nt2.48□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 ROY1YMR258C 1662 nt2.48□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 RPL37AYLR185W 267 nt2.48□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 CTK3YML112W 891 nt2.48□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 URA10YMR271C 684 nt2.48□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 YPR089WYPR089W 2667 nt2.48□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 SVL3YPL032C 2478 nt2.48□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 PRP6YBR055C 2700 nt2.48□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 YHR130CYHR130C 336 nt2.47□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 YPL197CYPL197C 414 nt2.47□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 YEF3YLR249W 3135 nt2.47□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 PSD2YGR170W 3417 nt2.47□□□□□ -2.01
AVL9Q12500 YCR001WYCR001W 315 nt2.46□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 MRP10YDL045W-A 288 nt2.46□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.46□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 COX13YGL191W 390 nt2.46□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 PKR1YMR123W 369 nt2.46□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 KTI11YBL071W-A 249 nt2.46□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 INP51YIL002C 2841 nt2.46□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 SPF1YEL031W 3648 nt2.46□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 KSP1YHR082C 3090 nt2.45□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 ASM4YDL088C 1587 nt2.45□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 YCR064CYCR064C 411 nt2.45□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 BNA7YDR428C 786 nt2.45□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.45□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.45□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 YPS5YGL259W 498 nt2.45□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.45□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 DDR48YMR173W 1293 nt2.45□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 RPS7BYNL096C 573 nt2.45□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 HOS4YIL112W 3252 nt2.44□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.44□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 SPE1YKL184W 1401 nt2.44□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 BUB1YGR188C 3066 nt2.44□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 TMN3YER113C 2121 nt2.44□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.44□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 AAD16YFL057C 459 nt2.44□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 ACB1YGR037C 264 nt2.44□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 RAM2YKL019W 951 nt2.44□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.44□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 YLR458WYLR458W 381 nt2.44□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 YOR105WYOR105W 327 nt2.44□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 MGR1YCL044C 1254 nt2.44□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 BRO1YPL084W 2535 nt2.44□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 SCD5YOR329C 2619 nt2.44□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 PES4YFR023W 1836 nt2.44□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 MLH1YMR167W 2310 nt2.43□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 RVS161YCR009C 798 nt2.43□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 SMB1YER029C 591 nt2.43□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 BIG1YHR101C 1008 nt2.43□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 RPL40AYIL148W 387 nt2.43□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 TIM8YJR135W-A 264 nt2.43□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 SAS2YMR127C 1017 nt2.43□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 NOP15YNL110C 663 nt2.43□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 SPC29YPL124W 762 nt2.43□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 ATP15YPL271W 189 nt2.43□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.43□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 TOR1YJR066W 7413 nt2.43□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 SSY1YDR160W 2559 nt2.43□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 OSW7YFR039C 1533 nt2.42□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 snR70snR70 164 nt2.42□□□□□ -2.02
AVL9Q12500 YFH1YDL120W 525 nt2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.8 ms