Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.5□□□□□ -2.01
SEF1P34228 SPE1YKL184W 1401 nt2.5□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.49□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.49□□□□□ -2.01
SEF1P34228 BI2Q0110 1272 nt2.49□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YFL019CYFL019C 354 nt2.49□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YPS5YGL259W 498 nt2.49□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.49□□□□□ -2.01
SEF1P34228 LCL2YLR104W 396 nt2.49□□□□□ -2.01
SEF1P34228 RPL37AYLR185W 267 nt2.49□□□□□ -2.01
SEF1P34228 RPS29AYLR388W 171 nt2.49□□□□□ -2.01
SEF1P34228 DDR48YMR173W 1293 nt2.49□□□□□ -2.01
SEF1P34228 RPL25YOL127W 429 nt2.49□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YPL205CYPL205C 345 nt2.49□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YPR177CYPR177C 372 nt2.49□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YPL216WYPL216W 3309 nt2.49□□□□□ -2.01
SEF1P34228 FAR11YNL127W 2862 nt2.49□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YDR239CYDR239C 2364 nt2.49□□□□□ -2.01
SEF1P34228 HYP2YEL034W 474 nt2.48□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.48□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YGR050CYGR050C 357 nt2.48□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YKR033CYKR033C 426 nt2.48□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YDR186CYDR186C 2634 nt2.48□□□□□ -2.01
SEF1P34228 NAB3YPL190C 2409 nt2.48□□□□□ -2.01
SEF1P34228 HRD3YLR207W 2502 nt2.47□□□□□ -2.01
SEF1P34228 PRP6YBR055C 2700 nt2.47□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.47□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.47□□□□□ -2.01
SEF1P34228 RPI1YIL119C 1224 nt2.47□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YLR458WYLR458W 381 nt2.47□□□□□ -2.01
SEF1P34228 NOP15YNL110C 663 nt2.47□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.47□□□□□ -2.01
SEF1P34228 GUP1YGL084C 1683 nt2.47□□□□□ -2.01
SEF1P34228 SMY2YBR172C 2223 nt2.46□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YKU80YMR106C 1890 nt2.46□□□□□ -2.02
SEF1P34228 SMB1YER029C 591 nt2.46□□□□□ -2.02
SEF1P34228 GET1YGL020C 708 nt2.46□□□□□ -2.02
SEF1P34228 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.46□□□□□ -2.02
SEF1P34228 YJR079WYJR079W 330 nt2.46□□□□□ -2.02
SEF1P34228 YJR157WYJR157W 363 nt2.46□□□□□ -2.02
SEF1P34228 RPS7BYNL096C 573 nt2.46□□□□□ -2.02
SEF1P34228 YHR078WYHR078W 1659 nt2.46□□□□□ -2.02
SEF1P34228 PDR3YBL005W 2931 nt2.46□□□□□ -2.02
SEF1P34228 HAA1YPR008W 2085 nt2.46□□□□□ -2.02
SEF1P34228 NEW1YPL226W 3591 nt2.46□□□□□ -2.02
SEF1P34228 TCB2YNL087W 3537 nt2.46□□□□□ -2.02
SEF1P34228 INP51YIL002C 2841 nt2.46□□□□□ -2.02
SEF1P34228 YPR089WYPR089W 2667 nt2.45□□□□□ -2.02
SEF1P34228 BRO1YPL084W 2535 nt2.45□□□□□ -2.02
SEF1P34228 YGR067CYGR067C 2415 nt2.45□□□□□ -2.02
SEF1P34228 AAD16YFL057C 459 nt2.45□□□□□ -2.02
SEF1P34228 RPL40AYIL148W 387 nt2.45□□□□□ -2.02
SEF1P34228 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.45□□□□□ -2.02
SEF1P34228 RAM2YKL019W 951 nt2.45□□□□□ -2.02
SEF1P34228 JIP3YLR331C 378 nt2.45□□□□□ -2.02
SEF1P34228 YML108WYML108W 318 nt2.45□□□□□ -2.02
SEF1P34228 ICY1YMR195W 384 nt2.45□□□□□ -2.02
SEF1P34228 TOM22YNL131W 459 nt2.45□□□□□ -2.02
SEF1P34228 YOR105WYOR105W 327 nt2.45□□□□□ -2.02
SEF1P34228 DGK1YOR311C 873 nt2.45□□□□□ -2.02
SEF1P34228 MGR1YCL044C 1254 nt2.45□□□□□ -2.02
SEF1P34228 SWA2YDR320C 2007 nt2.45□□□□□ -2.02
SEF1P34228 HOS4YIL112W 3252 nt2.45□□□□□ -2.02
SEF1P34228 BNR1YIL159W 4128 nt2.45□□□□□ -2.02
SEF1P34228 YNL018CYNL018C 1839 nt2.45□□□□□ -2.02
SEF1P34228 MUD2YKL074C 1584 nt2.44□□□□□ -2.02
SEF1P34228 YPL150WYPL150W 2706 nt2.44□□□□□ -2.02
SEF1P34228 KRE33YNL132W 3171 nt2.44□□□□□ -2.02
SEF1P34228 TIM8YJR135W-A 264 nt2.44□□□□□ -2.02
SEF1P34228 BET3YKR068C 582 nt2.44□□□□□ -2.02
SEF1P34228 RMP1YLR145W 606 nt2.44□□□□□ -2.02
SEF1P34228 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.44□□□□□ -2.02
SEF1P34228 RPB5YBR154C 648 nt2.44□□□□□ -2.02
SEF1P34228 UBP15YMR304W 3693 nt2.44□□□□□ -2.02
SEF1P34228 SSY1YDR160W 2559 nt2.44□□□□□ -2.02
SEF1P34228 MRD1YPR112C 2664 nt2.44□□□□□ -2.02
SEF1P34228 KSP1YHR082C 3090 nt2.43□□□□□ -2.02
SEF1P34228 AYT1YLL063C 1425 nt2.43□□□□□ -2.02
SEF1P34228 AIM29YKR074W 468 nt2.43□□□□□ -2.02
SEF1P34228 ATP15YPL271W 189 nt2.43□□□□□ -2.02
SEF1P34228 ORC2YBR060C 1863 nt2.43□□□□□ -2.02
SEF1P34228 PES4YFR023W 1836 nt2.42□□□□□ -2.02
SEF1P34228 SLN1YIL147C 3663 nt2.42□□□□□ -2.02
SEF1P34228 ACB1YGR037C 264 nt2.42□□□□□ -2.02
SEF1P34228 RPS22AYJL190C 393 nt2.42□□□□□ -2.02
SEF1P34228 SGM1YJR134C 2124 nt2.42□□□□□ -2.02
SEF1P34228 HSC82YMR186W 2118 nt2.42□□□□□ -2.02
SEF1P34228 TRA1YHR099W 11235 nt2.42□□□□□ -2.02
SEF1P34228 OSW7YFR039C 1533 nt2.42□□□□□ -2.02
SEF1P34228 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.42□□□□□ -2.02
SEF1P34228 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.42□□□□□ -2.02
SEF1P34228 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.42□□□□□ -2.02
SEF1P34228 INP53YOR109W 3324 nt2.41□□□□□ -2.02
SEF1P34228 ECL1YGR146C 636 nt2.41□□□□□ -2.02
SEF1P34228 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.41□□□□□ -2.02
SEF1P34228 AIM32YML050W 936 nt2.41□□□□□ -2.02
SEF1P34228 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.41□□□□□ -2.02
SEF1P34228 ACM1YPL267W 630 nt2.41□□□□□ -2.02
SEF1P34228 snR41snR41 95 nt2.41□□□□□ -2.02
SEF1P34228 snR54snR54 86 nt2.41□□□□□ -2.02
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