Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 STE11YLR362W 2154 nt2.56□□□□□ -2
YBL055CP34220 DNL4YOR005C 2835 nt2.55□□□□□ -2
YBL055CP34220 YDL032WYDL032W 312 nt2.55□□□□□ -2
YBL055CP34220 SPF1YEL031W 3648 nt2.55□□□□□ -2
YBL055CP34220 GLC7YER133W 939 nt2.55□□□□□ -2
YBL055CP34220 PEP8YJL053W 1140 nt2.55□□□□□ -2
YBL055CP34220 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.55□□□□□ -2
YBL055CP34220 YKL063CYKL063C 504 nt2.55□□□□□ -2
YBL055CP34220 BET3YKR068C 582 nt2.55□□□□□ -2
YBL055CP34220 RPL37AYLR185W 267 nt2.55□□□□□ -2
YBL055CP34220 PHO91YNR013C 2685 nt2.55□□□□□ -2
YBL055CP34220 RPB11YOL005C 363 nt2.55□□□□□ -2
YBL055CP34220 YOL134CYOL134C 390 nt2.55□□□□□ -2
YBL055CP34220 NDD1YOR372C 1665 nt2.55□□□□□ -2
YBL055CP34220 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.55□□□□□ -2
YBL055CP34220 ISW1YBR245C 3390 nt2.55□□□□□ -2
YBL055CP34220 snR54snR54 86 nt2.55□□□□□ -2
YBL055CP34220 NEW1YPL226W 3591 nt2.55□□□□□ -2
YBL055CP34220 SVL3YPL032C 2478 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 TPS2YDR074W 2691 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 snR76snR76 109 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 TPM2YIL138C 486 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 EMC6YLL014W 327 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 SAS2YMR127C 1017 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 YER138CYER138C 5268 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 YER160CYER160C 5268 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 YJR027WYJR027W 5268 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 YML039WYML039W 5268 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 YML045WYML045W 5268 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 YMR050CYMR050C 5268 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 MDM32YOR147W 1869 nt2.54□□□□□ -2
YBL055CP34220 PPN1YDR452W 2025 nt2.53□□□□□ -2
YBL055CP34220 RGM1YMR182C 636 nt2.53□□□□□ -2
YBL055CP34220 KTI11YBL071W-A 249 nt2.53□□□□□ -2
YBL055CP34220 TOP2YNL088W 4287 nt2.53□□□□□ -2
YBL055CP34220 RLI1YDR091C 1827 nt2.53□□□□□ -2
YBL055CP34220 ROY1YMR258C 1662 nt2.53□□□□□ -2
YBL055CP34220 GET1YGL020C 708 nt2.52□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 YIL058WYIL058W 285 nt2.52□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.52□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 URA10YMR271C 684 nt2.52□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 FPR1YNL135C 345 nt2.52□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 PDR3YBL005W 2931 nt2.52□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 VPS13YLL040C 9435 nt2.52□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 BAS1YKR099W 2436 nt2.52□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 MSB1YOR188W 3414 nt2.52□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 ECM25YJL201W 1800 nt2.52□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 SSE1YPL106C 2082 nt2.51□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 PSO2YMR137C 1986 nt2.51□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 HYP2YEL034W 474 nt2.51□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 YJR079WYJR079W 330 nt2.51□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 CRS5YOR031W 210 nt2.51□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 DGK1YOR311C 873 nt2.51□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 TRM7YBR061C 933 nt2.51□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 UBP15YMR304W 3693 nt2.5□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 YCR064CYCR064C 411 nt2.5□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 YDR114CYDR114C 303 nt2.5□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 GPI8YDR331W 1236 nt2.5□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 HYR1YIR037W 492 nt2.5□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.5□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 IGO1YNL157W 507 nt2.5□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 FYV12YOR183W 390 nt2.5□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 SGS1YMR190C 4344 nt2.5□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 SDC25YLL016W 3147 nt2.5□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 YDR239CYDR239C 2364 nt2.5□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 PDR11YIL013C 4236 nt2.5□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 SSY1YDR160W 2559 nt2.49□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 snR70snR70 164 nt2.49□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 ATP6Q0085 780 nt2.49□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.49□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.49□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 YHR125WYHR125W 306 nt2.49□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 YLR101CYLR101C 396 nt2.49□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 RPS29AYLR388W 171 nt2.49□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt2.49□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 RPS1AYLR441C 768 nt2.49□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 RPL25YOL127W 429 nt2.49□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 snR43snR43 209 nt2.49□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 FAR11YNL127W 2862 nt2.48□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 YBT1YLL048C 4986 nt2.48□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 RNH70YGR276C 1662 nt2.48□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 HMRA1YCR097W 381 nt2.48□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 YGL165CYGL165C 579 nt2.48□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 YLR269CYLR269C 351 nt2.48□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 AIM32YML050W 936 nt2.48□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 TIF11YMR260C 462 nt2.48□□□□□ -2.01
YBL055CP34220 RPS7BYNL096C 573 nt2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.7 ms