Protein–RNA interactions for Protein: Q9P107

GMIP, GEM-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMIPQ9P107 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GMIPQ9P107 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMIPQ9P107 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms