Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIRT1Q96EB6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms