Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 MED8YBR193C 672 nt2□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 UBR1YGR184C 5853 nt2□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 GYP5YPL249C 2685 nt2□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 ASG1YIL130W 2895 nt2□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 NUP100YKL068W 2880 nt2□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 MES1YGR264C 2256 nt2□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 GDI1YER136W 1356 nt1.99□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 YDR199WYDR199W 366 nt1.99□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 YDR203WYDR203W 318 nt1.99□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 YDR248CYDR248C 582 nt1.99□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 RSM18YER050C 417 nt1.99□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 RPS17AYML024W 411 nt1.99□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 YPR089WYPR089W 2667 nt1.99□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 YEL043WYEL043W 2871 nt1.98□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 VPS16YPL045W 2397 nt1.98□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 PBP4YDL053C 558 nt1.98□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.98□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 EMP24YGL200C 612 nt1.98□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 YNL179CYNL179C 438 nt1.98□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 YNL235CYNL235C 432 nt1.98□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.98□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 YBR197CYBR197C 654 nt1.98□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 YBR277CYBR277C 402 nt1.98□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 RAV1YJR033C 4074 nt1.98□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 SSY1YDR160W 2559 nt1.97□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 YNL034WYNL034W 1839 nt1.97□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 snR59snR59 78 nt1.97□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 YCR099CYCR099C 468 nt1.97□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 YDL163WYDL163W 303 nt1.97□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 YDR115WYDR115W 318 nt1.97□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 YGL165CYGL165C 579 nt1.97□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 ICY1YMR195W 384 nt1.97□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 SLM4YBR077C 489 nt1.97□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 YPR170CYPR170C 336 nt1.97□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 SNU114YKL173W 3027 nt1.96□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 YOL150CYOL150C 312 nt1.96□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 RSA1YPL193W 1146 nt1.96□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 NSL1YPL233W 651 nt1.96□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 ATP20YPR020W 348 nt1.96□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 KAR9YPL269W 1935 nt1.95□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 PEA2YER149C 1263 nt1.95□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 YGL042CYGL042C 306 nt1.95□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt1.95□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 SPO11YHL022C 1197 nt1.95□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt1.95□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 RRF1YHR038W 693 nt1.95□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 YIL082WYIL082W 873 nt1.95□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 ACF4YJR083C 930 nt1.95□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 SIP18YMR175W 240 nt1.95□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 IGO1YNL157W 507 nt1.95□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 RBL2YOR265W 321 nt1.95□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 YCL002CYCL002C 792 nt1.95□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 ECM25YJL201W 1800 nt1.95□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 COS111YBR203W 2775 nt1.95□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 SSF2YDR312W 1362 nt1.95□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 ATG11YPR049C 3537 nt1.95□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 SHE4YOR035C 2370 nt1.94□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 FAB1YFR019W 6837 nt1.94□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 FAR7YFR008W 666 nt1.94□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 PGD1YGL025C 1194 nt1.94□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 YLR224WYLR224W 1110 nt1.94□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 YNL319WYNL319W 441 nt1.94□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 SPP41YDR464W 4308 nt1.94□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 SSQ1YLR369W 1974 nt1.94□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 BAS1YKR099W 2436 nt1.93□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 IRC2YDR112W 309 nt1.93□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 PRS3YHL011C 963 nt1.93□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 SDL1YIL167W 633 nt1.93□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 YJL119CYJL119C 324 nt1.93□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 YBL012CYBL012C 402 nt1.93□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 YNL050CYNL050C 813 nt1.93□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 ATX2YOR079C 942 nt1.93□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 YBR063CYBR063C 1215 nt1.93□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 NEO1YIL048W 3456 nt1.93□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 MGM1YOR211C 2646 nt1.93□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 STD1YOR047C 1335 nt1.92□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 SEC31YDL195W 3822 nt1.92□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 VPS74YDR372C 1038 nt1.92□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 TDA2YER071C 381 nt1.92□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 MND1YGL183C 660 nt1.92□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 YJL147CYJL147C 1149 nt1.92□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 SDS22YKL193C 1017 nt1.92□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 RMP1YLR145W 606 nt1.92□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 PDP3YLR455W 915 nt1.92□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 VTI1YMR197C 654 nt1.92□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 UBP2YOR124C 3819 nt1.92□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 YPL034WYPL034W 498 nt1.92□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 TAZ1YPR140W 1146 nt1.92□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 PSK2YOL045W 3306 nt1.92□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 GIS1YDR096W 2685 nt1.92□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 PES4YFR023W 1836 nt1.91□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 DAD4YDR320C-A 219 nt1.91□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 ERG29YMR134W 714 nt1.91□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 YMR144WYMR144W 1029 nt1.91□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 SIR4YDR227W 4077 nt1.91□□□□□ -2.1
RRP42Q12277 GPM2YDL021W 936 nt1.9□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 GPI8YDR331W 1236 nt1.9□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 TSA2YDR453C 591 nt1.9□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20 ms