Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 YLR434CYLR434C 384 nt2.86□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 RPL20BYOR312C 519 nt2.86□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 CEP3YMR168C 1827 nt2.86□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 KHA1YJL094C 2622 nt2.86□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 YCK2YNL154C 1641 nt2.86□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 YAT2YER024W 2772 nt2.85□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 ROM1YGR070W 3468 nt2.85□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 RRT13YER066W 558 nt2.85□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.85□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 SEN54YPL083C 1404 nt2.85□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 RAX2YLR084C 3663 nt2.84□□□□□ -1.95 RIP-Chip
PUF2Q12221 SDH7YDR511W 402 nt2.84□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 SMB1YER029C 591 nt2.84□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 YGR035CYGR035C 351 nt2.84□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 COQ10YOL008W 624 nt2.84□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 OST2YOR103C 393 nt2.84□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 RPL33AYPL143W 324 nt2.84□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 SSP1YHR184W 1716 nt2.84□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 JJJ2YJL162C 1752 nt2.84□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 BFR1YOR198C 1413 nt2.84□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 MET5YJR137C 4329 nt2.84□□□□□ -1.96 RIP-Chip
PUF2Q12221 URB2YJR041C 3525 nt2.84□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 RSE1YML049C 4086 nt2.83□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YJR098CYJR098C 1971 nt2.83□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 ATP22YDR350C 2055 nt2.83□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 CCT7YJL111W 1653 nt2.83□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 RMT2YDR465C 1239 nt2.83□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 RPS24BYIL069C 408 nt2.83□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YNL179CYNL179C 438 nt2.83□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 ERP4YOR016C 624 nt2.83□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 PEP12YOR036W 867 nt2.83□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 UTP13YLR222C 2454 nt2.83□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 SRC1YML034W 2505 nt2.83□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 GNT1YOR320C 1476 nt2.83□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 NDT80YHR124W 1884 nt2.82□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 DYN2YDR424C 279 nt2.82□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YGL165CYGL165C 579 nt2.82□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.82□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 PEX17YNL214W 600 nt2.82□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YOR121CYOR121C 306 nt2.82□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.82□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 SWD3YBR175W 948 nt2.82□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 ATG13YPR185W 2217 nt2.82□□□□□ -1.96 RIP-Chip
PUF2Q12221 KAP104YBR017C 2757 nt2.82□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 SLP1YOR154W 1764 nt2.82□□□□□ -1.96 RIP-Chip
PUF2Q12221 ARK1YNL020C 1917 nt2.81□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.81□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.81□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.81□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.81□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.81□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YCL019WYCL019W 5313 nt2.81□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 UBP14YBR058C 2346 nt2.81□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 SOK1YDR006C 2706 nt2.81□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 PDC2YDR081C 2778 nt2.81□□□□□ -1.96 RIP-Chip
PUF2Q12221 ITC1YGL133W 3795 nt2.81□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.81□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YER137W-AYER137W-A 306 nt2.81□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 VOA1YGR106C 798 nt2.81□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 ABM1YJR108W 372 nt2.81□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 JIP3YLR331C 378 nt2.81□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.81□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 RNH70YGR276C 1662 nt2.81□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 VPS64YDR200C 1815 nt2.81□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YEL1YBL060W 2064 nt2.81□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 ICR1ICR1 3199 nt2.8□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 MED1YPR070W 1701 nt2.8□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.8□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 SDC1YDR469W 528 nt2.8□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 RPS26BYER131W 360 nt2.8□□□□□ -1.96 RIP-Chip
PUF2Q12221 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.8□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.8□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YIL012WYIL012W 342 nt2.8□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 MAM33YIL070C 801 nt2.8□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 GPI14YJR013W 1212 nt2.8□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YKL083WYKL083W 615 nt2.8□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 MRPL31YKL138C 396 nt2.8□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YLR302CYLR302C 363 nt2.8□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 UBC7YMR022W 498 nt2.8□□□□□ -1.96 RIP-Chip
PUF2Q12221 ZEO1YOL109W 342 nt2.8□□□□□ -1.96 RIP-Chip
PUF2Q12221 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt2.8□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 GYP7YDL234C 2241 nt2.8□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YKL100CYKL100C 1764 nt2.79□□□□□ -1.96 RIP-Chip
PUF2Q12221 BUD4YJR092W 4344 nt2.79□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 TSC11YER093C 4293 nt2.79□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 PSK1YAL017W 4071 nt2.79□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 LAG1YHL003C 1236 nt2.79□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YKL118WYKL118W 312 nt2.79□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 MRPL50YNR022C 420 nt2.79□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 TSC3YBR058C-A 243 nt2.79□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YPL276WYPL276W 438 nt2.79□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt2.79□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 AI2Q0055 2565 nt2.79□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 TCB2YNL087W 3537 nt2.79□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 ALY1YKR021W 2748 nt2.78□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YPL150WYPL150W 2706 nt2.78□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 AYT1YLL063C 1425 nt2.78□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YCR022CYCR022C 345 nt2.78□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YDR366CYDR366C 399 nt2.78□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 YLR230WYLR230W 306 nt2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 60.4 ms