Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

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Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 SLX4YLR135W 2247 nt4.96□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 MUK1YPL070W 1839 nt4.95□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 SED4YCR067C 3198 nt4.95□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 RPS0AYGR214W 759 nt4.95□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 HIR2YOR038C 2628 nt4.95□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 NHX1YDR456W 1902 nt4.95□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 ARN1YHL040C 1884 nt4.94□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 ATP7YKL016C 525 nt4.94□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 TMA19YKL056C 504 nt4.94□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt4.94□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 RPS7AYOR096W 573 nt4.94□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 GCD6YDR211W 2139 nt4.94□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 YOL057WYOL057W 2136 nt4.94□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 LYP1YNL268W 1836 nt4.93□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 PAA1YDR071C 576 nt4.93□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt4.93□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 RPL33AYPL143W 324 nt4.93□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 YPL278CYPL278C 303 nt4.93□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 NTC20YBR188C 423 nt4.93□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 APC5YOR249C 2058 nt4.93□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 YBR238CYBR238C 2196 nt4.92□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 VPS54YDR027C 2670 nt4.92□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 TPS2YDR074W 2691 nt4.92□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 KGD1YIL125W 3045 nt4.92□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 snR17bsnR17b 332 nt4.92□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 VAC14YLR386W 2643 nt4.92□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 TRM44YPL030W 1704 nt4.92□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 PBS2YJL128C 2007 nt4.91□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 SEG2YKL105C 3399 nt4.91□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 ZRG17YNR039C 1818 nt4.9□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 MES1YGR264C 2256 nt4.9□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 SUM1YDR310C 3189 nt4.9□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 TAF5YBR198C 2397 nt4.9□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 OST4YDL232W 111 nt4.9□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 SNA2YDR525W-A 240 nt4.9□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 YER091C-AYER091C-A 222 nt4.9□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.9□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 FYV10YIL097W 1551 nt4.9□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 TFB1YDR311W 1929 nt4.89□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 SEC9YGR009C 1956 nt4.89□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 RBK1YCR036W 1002 nt4.89□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 YDR286CYDR286C 345 nt4.89□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 AUA1YFL010W-A 285 nt4.89□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 HHF1YBR009C 312 nt4.89□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 VID22YLR373C 2706 nt4.88□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 GPI1YGR216C 1830 nt4.88□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 SSS1YDR086C 243 nt4.88□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 KRE6YPR159W 2163 nt4.88□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 PEX5YDR244W 1839 nt4.88□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 BUD6YLR319C 2367 nt4.87□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 MET12YPL023C 1974 nt4.87□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 YIR044CYIR044C 186 nt4.87□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 COA3YJL062W-A 258 nt4.87□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 YAL065CYAL065C 387 nt4.87□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 EMC6YLL014W 327 nt4.87□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 RPL38YLR325C 237 nt4.87□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 RPS18BYML026C 441 nt4.87□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 ISU1YPL135W 498 nt4.87□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 DFG16YOR030W 1860 nt4.87□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 AXL2YIL140W 2472 nt4.87□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 KEL2YGR238C 2649 nt4.87□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 AFT1YGL071W 2073 nt4.87□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 COX14YML129C 213 nt4.86□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 YDR239CYDR239C 2364 nt4.86□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 SNF3YDL194W 2655 nt4.86□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 BAS1YKR099W 2436 nt4.85□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 YIL165CYIL165C 360 nt4.85□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 YIL166CYIL166C 1629 nt4.85□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 UBP10YNL186W 2379 nt4.85□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 SAP4YGL229C 2457 nt4.85□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 PXA1YPL147W 2613 nt4.85□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 OPT2YPR194C 2634 nt4.85□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 YAK1YJL141C 2424 nt4.84□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 PUF6YDR496C 1971 nt4.84□□□□□ -1.63
NCR1Q12200 YGR266WYGR266W 2106 nt4.84□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 APC1YNL172W 5247 nt4.83□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 COX23YHR116W 456 nt4.83□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 YPR053CYPR053C 456 nt4.83□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 COY1YKL179C 2040 nt4.83□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 YCR023CYCR023C 1836 nt4.83□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 FLO8YER109C 2400 nt4.83□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 GYP7YDL234C 2241 nt4.82□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 PRM7YDL039C 2097 nt4.82□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 PDC2YDR081C 2778 nt4.82□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 RRM3YHR031C 2172 nt4.82□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 ACE2YLR131C 2313 nt4.81□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 TIF4631YGR162W 2859 nt4.81□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 PTA1YAL043C 2358 nt4.81□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 ERP6YGL002W 651 nt4.81□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 YOR345CYOR345C 351 nt4.81□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt4.81□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 FRE2YKL220C 2136 nt4.81□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 MCM4YPR019W 2802 nt4.8□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 KIN4YOR233W 2403 nt4.8□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 YER078W-AYER078W-A 165 nt4.8□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 YLR255CYLR255C 354 nt4.8□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 NOP4YPL043W 2058 nt4.8□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 BOI2YER114C 3123 nt4.8□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 SBE2YDR351W 2595 nt4.79□□□□□ -1.64
NCR1Q12200 KAP114YGL241W 3015 nt4.79□□□□□ -1.64
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