Protein–RNA interactions for Protein: Q12080

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP53Q12080 PEX11YOL147C 711 nt5.18□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 RAD1YPL022W 3303 nt5.18□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 ALG8YOR067C 1734 nt5.17□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 CWH41YGL027C 2502 nt5.17□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 LSM1YJL124C 519 nt5.17□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 RFC3YNL290W 1023 nt5.17□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 AIM9YER080W 1884 nt5.17□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 DIP2YLR129W 2832 nt5.17□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 HBT1YDL223C 3141 nt5.17□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 COP1YDL145C 3606 nt5.16□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt5.16□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt5.16□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt5.16□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt5.16□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt5.16□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5.16□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5.16□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5.16□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5.16□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5.16□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5.16□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.16□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.16□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.16□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 PEP5YMR231W 3090 nt5.16□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 AIM21YIR003W 2040 nt5.16□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 ATP25YMR098C 1839 nt5.16□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 CUL3YGR003W 2235 nt5.15□□□□□ -1.58
NOP53Q12080 FBP1YLR377C 1047 nt5.15□□□□□ -1.59
NOP53Q12080 CCT7YJL111W 1653 nt5.15□□□□□ -1.59
NOP53Q12080 YOL075CYOL075C 3885 nt5.14□□□□□ -1.59
NOP53Q12080 SPT10YJL127C 1923 nt5.14□□□□□ -1.59
NOP53Q12080 CHL1YPL008W 2586 nt5.13□□□□□ -1.59
NOP53Q12080 snR7-SsnR7-S 179 nt5.12□□□□□ -1.59
NOP53Q12080 YMR321CYMR321C 318 nt5.12□□□□□ -1.59
NOP53Q12080 MTR10YOR160W 2919 nt5.11□□□□□ -1.59
NOP53Q12080 VHS3YOR054C 2025 nt5.11□□□□□ -1.59
NOP53Q12080 YBR224WYBR224W 516 nt5.11□□□□□ -1.59
NOP53Q12080 VIP1YLR410W 3441 nt5.1□□□□□ -1.59
NOP53Q12080 YPK9YOR291W 4419 nt5.1□□□□□ -1.59
NOP53Q12080 YPL182CYPL182C 384 nt5.1□□□□□ -1.59
NOP53Q12080 OSH2YDL019C 3852 nt5.1□□□□□ -1.59
NOP53Q12080 SRO7YPR032W 3102 nt5.1□□□□□ -1.59
NOP53Q12080 PDR5YOR153W 4536 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP53Q12080 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP53Q12080 MNT3YIL014W 1893 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP53Q12080 CWH43YCR017C 2862 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP53Q12080 PCC1YKR095W-A 267 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP53Q12080 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt5.09□□□□□ -1.59
NOP53Q12080 SLP1YOR154W 1764 nt5.09□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 BIT61YJL058C 1632 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 ISM1YPL040C 3009 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 NUP2YLR335W 2163 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 TSA2YDR453C 591 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 FMP32YFL046W 624 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 TIM13YGR181W 318 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 YHL041WYHL041W 450 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 RDN5-1RDN5-1 121 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 RDN5-6RDN5-6 121 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 ISU1YPL135W 498 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 TRM7YBR061C 933 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 VAC7YNL054W 3498 nt5.08□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 UPC2YDR213W 2742 nt5.07□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 YGL217CYGL217C 342 nt5.07□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 CCW14YLR390W-A 717 nt5.07□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 FRE8YLR047C 2061 nt5.07□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 LCB5YLR260W 2064 nt5.07□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 MSS11YMR164C 2277 nt5.07□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 SSY1YDR160W 2559 nt5.07□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 JJJ2YJL162C 1752 nt5.06□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 SPT23YKL020C 3249 nt5.06□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 RPL23AYBL087C 414 nt5.06□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 HHF1YBR009C 312 nt5.06□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 YPR063CYPR063C 423 nt5.06□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 OM14YBR230C 405 nt5.06□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 YNR065CYNR065C 3351 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 NAT1YDL040C 2565 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 RIA1YNL163C 3333 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 IGO2YHR132W-A 396 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 RPL14AYKL006W 417 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 HHT1YBR010W 411 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 IMH1YLR309C 2736 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 YLL007CYLL007C 1998 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 ARO80YDR421W 2853 nt5.05□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 TCO89YPL180W 2400 nt5.04□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 SRL3YKR091W 741 nt5.04□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 YOR015WYOR015W 360 nt5.04□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 snR52snR52 92 nt5.04□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 YDR544CYDR544C 429 nt5.03□□□□□ -1.6
NOP53Q12080 NCE101YJL205C 162 nt5.03□□□□□ -1.6
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