Protein–RNA interactions for Protein: Q06451

TPO3, Polyamine transporter 3, yeastyeast

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TPO3Q06451 YCR022CYCR022C 345 nt2.82□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 YDL068WYDL068W 330 nt2.82□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 YDR366CYDR366C 399 nt2.82□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 YHL037CYHL037C 402 nt2.82□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt2.82□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 VTI1YMR197C 654 nt2.82□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 SLM6YBR266C 453 nt2.82□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 KIN82YCR091W 2163 nt2.82□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 AKR1YDR264C 2295 nt2.82□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 DIE2YGR227W 1578 nt2.82□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 CDH1YGL003C 1701 nt2.82□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 SNF12YNR023W 1701 nt2.82□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 MED1YPR070W 1701 nt2.82□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 MDM32YOR147W 1869 nt2.82□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 UBP14YBR058C 2346 nt2.81□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 BNI4YNL233W 2679 nt2.81□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 SEC15YGL233W 2733 nt2.81□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 YDL152WYDL152W 366 nt2.81□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 YDR193WYDR193W 399 nt2.81□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 RPS23AYGR118W 438 nt2.81□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.81□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 RPS7BYNL096C 573 nt2.81□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 VHR2YER064C 1518 nt2.81□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 VBA4YDR119W 2307 nt2.81□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 FLO5YHR211W 3228 nt2.8□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 TRZ1YKR079C 2517 nt2.8□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 SPC72YAL047C 1869 nt2.8□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 YKL100CYKL100C 1764 nt2.8□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 NHP2YDL208W 471 nt2.8□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 ATP17YDR377W 306 nt2.8□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 IRC4YDR540C 540 nt2.8□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 NOP19YGR251W 591 nt2.8□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 RPC10YHR143W-A 213 nt2.8□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 YJR023CYJR023C 402 nt2.8□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 YKL083WYKL083W 615 nt2.8□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 NSL1YPL233W 651 nt2.8□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 YPL276WYPL276W 438 nt2.8□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 REG1YDR028C 3045 nt2.8□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 GCD6YDR211W 2139 nt2.8□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 RRM3YHR031C 2172 nt2.79□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.79□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.79□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 LSM8YJR022W 330 nt2.79□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 RPL37AYLR185W 267 nt2.79□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt2.79□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 YPR014CYPR014C 330 nt2.79□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 MNT3YIL014W 1893 nt2.79□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 ATG13YPR185W 2217 nt2.78□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 YJR003CYJR003C 1560 nt2.78□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 RIF1YBR275C 5751 nt2.78□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 YHR080CYHR080C 4038 nt2.78□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 RMT2YDR465C 1239 nt2.78□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 HPA3YEL066W 540 nt2.78□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 ERG28YER044C 447 nt2.78□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 YER097WYER097W 330 nt2.78□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 YGR107WYGR107W 450 nt2.78□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.78□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 ISU1YPL135W 498 nt2.78□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 NMD2YHR077C 3270 nt2.78□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 MDM1YML104C 3384 nt2.78□□□□□ -1.96
TPO3Q06451 SMC2YFR031C 3513 nt2.77□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 GCD10YNL062C 1437 nt2.77□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 PMR1YGL167C 2853 nt2.77□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 GPI8YDR331W 1236 nt2.77□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 YDR413CYDR413C 576 nt2.77□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 TIF35YDR429C 825 nt2.77□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 PAU10YDR542W 363 nt2.77□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.77□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 PAU11YGL261C 363 nt2.77□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 PAU4YLR461W 363 nt2.77□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 RPL19BYBL027W 570 nt2.77□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 TIM12YBR091C 330 nt2.77□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 YLR278CYLR278C 4026 nt2.77□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 NDT80YHR124W 1884 nt2.77□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 CWC22YGR278W 1734 nt2.76□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 CCT7YJL111W 1653 nt2.76□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 MRH1YDR033W 963 nt2.76□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 TSA2YDR453C 591 nt2.76□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.76□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 YKL111CYKL111C 336 nt2.76□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 YBL108WYBL108W 306 nt2.76□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 ATP3YBR039W 936 nt2.76□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 MSH2YOL090W 2895 nt2.75□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 TFC4YGR047C 3078 nt2.75□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 ATP22YDR350C 2055 nt2.75□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 NOP4YPL043W 2058 nt2.75□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 snR65snR65 100 nt2.74□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.74□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.74□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.74□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.74□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.74□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.74□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.74□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.74□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.74□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.74□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.74□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.74□□□□□ -1.97
TPO3Q06451 YAR053WYAR053W 297 nt2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.7 ms