Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms