Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	RPS17B	YDR447C	411 nt		2.02	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	TWF1	YGR080W	999 nt		2.02	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	ARL3	YPL051W	597 nt		2.02	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	RXT2	YBR095C	1293 nt		2.02	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	YPR089W	YPR089W	2667 nt		2.02	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	KSP1	YHR082C	3090 nt		2.02	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	SNU114	YKL173W	3027 nt		2.01	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	NCS2	YNL119W	1482 nt		2.01	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	NEO1	YIL048W	3456 nt		2.01	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	YER119C-A	YER119C-A	372 nt		2.01	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	SFM1	YOR021C	642 nt		2.01	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	YEL043W	YEL043W	2871 nt		2.01	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	DAL5	YJR152W	1632 nt		2.01	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	CDC37	YDR168W	1521 nt		2.01	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	RAV1	YJR033C	4074 nt		2	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	MRP10	YDL045W-A	288 nt		2	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	YRB1	YDR002W	606 nt		2	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	RSM18	YER050C	417 nt		2	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	SNO3	YFL060C	669 nt		2	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	YGR115C	YGR115C	780 nt		2	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	VPS63	YLR261C	327 nt		2	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	COX8	YLR395C	237 nt		2	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	RPS16A	YMR143W	432 nt		2	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	SNO2	YNL334C	669 nt		2	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	BRX1	YOL077C	876 nt		2	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	YOL085W-A	YOL085W-A	213 nt		2	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	YPR145C-A	YPR145C-A	237 nt		2	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	YPR147C	YPR147C	915 nt		2	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	VID24	YBR105C	1089 nt		2	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	POP7	YBR167C	423 nt		2	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	GIP3	YPL137C	3831 nt		2	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	SHS1	YDL225W	1656 nt		1.99	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	SSF2	YDR312W	1362 nt		1.99	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	PRP6	YBR055C	2700 nt		1.99	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	PEP1	YBL017C	4740 nt		1.99	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	YCR013C	YCR013C	648 nt		1.99	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	YDR248C	YDR248C	582 nt		1.99	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	SDC1	YDR469W	528 nt		1.99	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	NTF2	YER009W	378 nt		1.99	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	RPS26B	YER131W	360 nt		1.99	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	BUD19	YJL188C	309 nt		1.99	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	YMR320W	YMR320W	306 nt		1.99	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	SUS1	YBR111W-A	291 nt		1.99	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	TOF1	YNL273W	3717 nt		1.99	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	RGA2	YDR379W	3030 nt		1.99	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	YDL163W	YDL163W	303 nt		1.98	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	PGD1	YGL025C	1194 nt		1.98	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	LIN1	YHR156C	1023 nt		1.98	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	PET191	YJR034W	327 nt		1.98	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	YPT6	YLR262C	648 nt		1.98	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	YPL119C-A	YPL119C-A	264 nt		1.98	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	RRP12	YPL012W	3687 nt		1.98	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	KAR9	YPL269W	1935 nt		1.97	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	GAL80	YML051W	1308 nt		1.97	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	SET2	YJL168C	2202 nt		1.97	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	YDL118W	YDL118W	381 nt		1.97	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	YFH1	YDL120W	525 nt		1.97	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	TIM9	YEL020W-A	264 nt		1.97	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	LOC1	YFR001W	615 nt		1.97	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	ACB1	YGR037C	264 nt		1.97	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	PRP38	YGR075C	729 nt		1.97	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	YHR054C	YHR054C	1065 nt		1.97	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	YKL165C-A	YKL165C-A	234 nt		1.97	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	CSI1	YMR025W	888 nt		1.97	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	YBR197C	YBR197C	654 nt		1.97	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	YJL070C	YJL070C	2667 nt		1.97	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	VPS16	YPL045W	2397 nt		1.96	□□□□□ -2.09
ATG12	P38316	YFL012W-A	YFL012W-A	375 nt		1.96	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	YHR050W-A	YHR050W-A	171 nt		1.96	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	YMR254C	YMR254C	309 nt		1.96	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	RPL25	YOL127W	429 nt		1.96	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	YBR051W	YBR051W	351 nt		1.96	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	ADF1	YCL058W-A	342 nt		1.96	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	YHR214C-B	YHR214C-B	5382 nt		1.96	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	YIL080W	YIL080W	4722 nt		1.96	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	PES4	YFR023W	1836 nt		1.96	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	CTF13	YMR094W	1437 nt		1.95	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	RSM28	YDR494W	1086 nt		1.95	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	MND1	YGL183C	660 nt		1.95	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	COG2	YGR120C	789 nt		1.95	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	YBL012C	YBL012C	402 nt		1.95	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	IGO1	YNL157W	507 nt		1.95	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	MIX23	YBL107C	591 nt		1.95	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	YPL039W	YPL039W	951 nt		1.95	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	YCL002C	YCL002C	792 nt		1.95	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	LEU3	YLR451W	2661 nt		1.95	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	YDR179W-A	YDR179W-A	1392 nt		1.95	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	CBF2	YGR140W	2871 nt		1.95	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	YRR1	YOR162C	2433 nt		1.95	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	DIS3	YOL021C	3006 nt		1.94	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	YJL016W	YJL016W	1686 nt		1.94	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	YCR108C	YCR108C	192 nt		1.94	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	YGL109W	YGL109W	324 nt		1.94	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	YIP1	YGR172C	747 nt		1.94	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	FYV4	YHR059W	393 nt		1.94	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	YJL119C	YJL119C	324 nt		1.94	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	YJL133C-A	YJL133C-A	225 nt		1.94	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	YMR173W-A	YMR173W-A	1185 nt		1.94	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	YNL235C	YNL235C	432 nt		1.94	□□□□□ -2.1
ATG12	P38316	ARP7	YPR034W	1434 nt		1.93	□□□□□ -2.1

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