Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC78A2IDD5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms