Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TNIKQ9UKE5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNIKQ9UKE5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms