Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIRT1Q96EB6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIRT1Q96EB6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms