Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOHLH1Q5JUK2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms