Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms